More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1040 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1040  acetylglutamate kinase  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1068  N-acetylglutamate kinase  90.81 
 
 
272 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1257  acetylglutamate kinase  87.13 
 
 
272 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  39.62 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  37.5 
 
 
299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  38.08 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  39.02 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  38.08 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  38.08 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  37.01 
 
 
295 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  37.14 
 
 
294 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  37.55 
 
 
296 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  36.65 
 
 
295 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  36.65 
 
 
295 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  37.68 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  38.77 
 
 
304 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  38.58 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  36.65 
 
 
301 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  37.36 
 
 
301 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  36.3 
 
 
295 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1950  acetylglutamate kinase  35.79 
 
 
300 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  35.74 
 
 
309 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  35.74 
 
 
309 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  41.35 
 
 
284 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  36.43 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  35.74 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  39.13 
 
 
296 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  35.9 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  37.32 
 
 
303 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  37.45 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  35.56 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  37.09 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  36.46 
 
 
305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0880  acetylglutamate kinase  38.58 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00277635  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  36.9 
 
 
301 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  37.18 
 
 
292 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  38.87 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  34.8 
 
 
306 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  37.69 
 
 
282 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  36.94 
 
 
308 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  38.81 
 
 
309 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  36.8 
 
 
283 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  36.94 
 
 
308 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  37.31 
 
 
282 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  35.45 
 
 
292 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  34.66 
 
 
301 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  35.79 
 
 
301 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  35.77 
 
 
290 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  33.57 
 
 
312 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0415  acetylglutamate kinase  36.1 
 
 
299 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0188997  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  35.77 
 
 
290 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  35.42 
 
 
301 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  38.43 
 
 
344 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  34.3 
 
 
301 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  33.57 
 
 
301 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  34.3 
 
 
301 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
300 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
305 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  37.31 
 
 
310 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  37.32 
 
 
295 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  35.42 
 
 
290 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  36.16 
 
 
301 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  36.16 
 
 
301 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  37.04 
 
 
292 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  37.01 
 
 
296 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  34.31 
 
 
303 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  34.31 
 
 
303 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  34.81 
 
 
288 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  35.48 
 
 
292 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  35.42 
 
 
302 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  35.04 
 
 
299 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  36.94 
 
 
286 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  34.59 
 
 
287 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  35.42 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  36.19 
 
 
300 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  35.79 
 
 
300 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  37.04 
 
 
286 aa  156  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  36.3 
 
 
297 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  35.96 
 
 
287 aa  156  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  37.45 
 
 
292 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  36.65 
 
 
296 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  36.65 
 
 
296 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  35.51 
 
 
306 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  36.94 
 
 
300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  33.21 
 
 
301 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2911  acetylglutamate kinase  36.06 
 
 
303 aa  155  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  35.25 
 
 
298 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  34.06 
 
 
304 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  37.64 
 
 
287 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  35.29 
 
 
298 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  36.82 
 
 
292 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07341  acetylglutamate kinase  37.36 
 
 
308 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0444  acetylglutamate kinase  36.24 
 
 
323 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0594  acetylglutamate kinase  36.4 
 
 
321 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0675136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  35.38 
 
 
301 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  32.46 
 
 
280 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  35.16 
 
 
296 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  35.38 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  36.82 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  36.4 
 
 
291 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>