More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1038 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  90.78 
 
 		 358 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  100 
 
 		 358 aa  726    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  93.85 
 
 		 358 aa  691    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  67.72 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  66.86 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  67.34 
 
 		 360 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  52.86 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  51.99 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  53.2 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  47.91 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  48.73 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  49.56 
 
 		 397 aa  349  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.86 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  48.44 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  50 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  48.74 
 
 		 372 aa  348  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  48.19 
 
 		 427 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  48.19 
 
 		 427 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.19 
 
 		 437 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  48.19 
 
 		 427 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  47.18 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  46.89 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  47.74 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  47.59 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  49.58 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  49.43 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  49.43 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  47.26 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  49.7 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  50.74 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  46.09 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  47.55 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  47.18 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  46.44 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  47.18 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  48.28 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.89 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  48.6 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  47.63 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  47.08 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  48.42 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.01 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  50.3 
 
 		 566 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  46.96 
 
 		 370 aa  332  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  47.13 
 
 		 350 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  45.87 
 
 		 374 aa  332  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  46.31 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  46.31 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  46.8 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  49.12 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  45.61 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  51.23 
 
 		 352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  48.25 
 
 		 388 aa  328  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  46.24 
 
 		 387 aa  328  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  45.76 
 
 		 366 aa  328  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  47.77 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  49 
 
 		 350 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.74 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  49 
 
 		 350 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  46.8 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  47.77 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  49.38 
 
 		 351 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  46.51 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  46.8 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  44.19 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  44.35 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  45.82 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  46.78 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  46.8 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  46.8 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  46.8 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  45.61 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  46.22 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  42.82 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  46.22 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  46.22 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  45.89 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  46.8 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  46.53 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  47.31 
 
 		 361 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  47.11 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.75 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  46.24 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  46.24 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  45.06 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  44.63 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  46.09 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  46.51 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  45.06 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  45.93 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  46.31 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  46.51 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  44.13 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  47.92 
 
 		 345 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  45.95 
 
 		 383 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  46.07 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  44.81 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.48 
 
 		 347 aa  315  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  46.43 
 
 		 345 aa  316  5e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>