16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1034 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  126  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1250  hypothetical protein  98.44 
 
 
64 aa  124  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  92.19 
 
 
64 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  47.69 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  41.54 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  35 
 
 
303 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  37.5 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  41.94 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  32.81 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  35.48 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  33.87 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  35 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  34.85 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  40.3 
 
 
64 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.727128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>