59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1017 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  522  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  79.37 
 
 		 316 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1367 aa  72  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  30.45 
 
 		 4357 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.24 
 
 		 6678 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.12 
 
 		 1064 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  25.85 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.02 
 
 		 4433 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  25.64 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  27.64 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.85 
 
 		 3507 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  27.24 
 
 		 767 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  23.56 
 
 		 739 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  22.86 
 
 		 4761 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  42.35 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  25.93 
 
 		 846 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  27.14 
 
 		 865 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  27.91 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  30.98 
 
 		 3907 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.88 
 
 		 1013 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  24.37 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  21.3 
 
 		 1066 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1260 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 		 11716 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  24.63 
 
 		 1174 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  24.66 
 
 		 1035 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.01 
 
 		 598 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.19 
 
 		 864 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.6 
 
 		 848 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  29.21 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  22.61 
 
 		 754 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1101 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  24.68 
 
 		 981 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1576 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1374 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.94 
 
 		 1679 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.36 
 
 		 1310 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1931 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 703 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 1143 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2261  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.76 
 
 		 647 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00906111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  24.87 
 
 		 1121 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 		 1121 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  23.68 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  22.75 
 
 		 1413 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  24.02 
 
 		 2334 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  23.23 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 1112 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  27.93 
 
 		 1150 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1916 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  26.4 
 
 		 430 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  24.64 
 
 		 739 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1633  hypothetical protein  24.19 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 804 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  23.63 
 
 		 1121 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  22.17 
 
 		 307 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  22.67 
 
 		 1091 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  24.89 
 
 		 2447 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  24 
 
 		 1565 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>