35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1007 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1225  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  760    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000218903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1007  fructose 1,6-bisphosphatase  100 
 
 
365 aa  760    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1034  D-fructose 1,6-bisphosphatase  96.16 
 
 
365 aa  738    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000176813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2049  hypothetical protein  66.12 
 
 
385 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2266  D-fructose 1,6-bisphosphatase  67.78 
 
 
379 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0748752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3026  hypothetical protein  65.56 
 
 
379 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1839  hypothetical protein  67.69 
 
 
370 aa  508  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0128949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1859  protein of unknown function DUF100  69.17 
 
 
376 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.792166  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0607  protein of unknown function DUF100  63.16 
 
 
381 aa  494  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0665  protein of unknown function DUF100  66.39 
 
 
378 aa  491  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0432  protein of unknown function DUF100  60.7 
 
 
371 aa  478  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1563  hypothetical protein  61.71 
 
 
365 aa  474  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1333  hypothetical protein  59.35 
 
 
371 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1538  hypothetical protein  59.35 
 
 
371 aa  461  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000224376  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1328  hypothetical protein  60.83 
 
 
383 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.328704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1263  protein of unknown function DUF100  57.92 
 
 
382 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0196  hypothetical protein  60.11 
 
 
368 aa  456  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0634  hypothetical protein  59.73 
 
 
383 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.372461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1357  D-fructose 1,6-bisphosphatase  59.45 
 
 
383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1319  hypothetical protein  59.18 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2259  D-fructose 1,6-bisphosphatase  58.04 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1612  hypothetical protein  56.32 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.160162 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0171  hypothetical protein  58.24 
 
 
383 aa  441  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0141  hypothetical protein  57.88 
 
 
406 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0133  hypothetical protein  57.34 
 
 
399 aa  426  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.577746  normal  0.0224851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0111  D-fructose 1,6-bisphosphatase  57.34 
 
 
399 aa  424  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.150469 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1181  hypothetical protein  57.07 
 
 
399 aa  424  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1151  hypothetical protein  58.58 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2722  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.53 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1035  hypothetical protein  43.21 
 
 
381 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0625  hypothetical protein  38.74 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1562  fructose-1,6-bisphosphatase  38.48 
 
 
382 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0797  protein of unknown function DUF100  33.63 
 
 
298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.824742  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0221  fructose 1 6-bisphosphatase-like protein  60 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1327  hypothetical protein  37.86 
 
 
223 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372464  normal  0.720842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>