More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0079 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5150  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00141737  normal  0.070954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5643  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0112274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5631  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5626  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5619  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5037  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.90364e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0850  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.23811e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0596  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.24077e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0357  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00725974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2909 bp  1191  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0342  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0924378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0331  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0325  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0212799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0303  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.05814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.7794e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0092  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0130944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5648  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5676  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5683  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5039  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0878914  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5017  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5011  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.722253  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5005  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4995  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4989  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.748751  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4779  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.42795e-06  hitchhiker  4.00122e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4580  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.75737e-06  normal  0.14639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0210  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.47576e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5821  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0109285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5723  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2909 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00121297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5704  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5695  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.126325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5692  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5689  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5686  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2908 bp  1191  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.955939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0034  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 
2909 bp  1199  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0024  23S ribosomal RNA  84.3 
 
 
2847 bp  684  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00320172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0090  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 
2900 bp  872  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0087  23S ribosomal RNA  85.63 
 
 
2900 bp  864  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0084  23S ribosomal RNA  85.91 
 
 
2900 bp  888  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0759493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0067  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 
2900 bp  892  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0064  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 
2900 bp  892  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0029  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 
2900 bp  892  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0017  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 
2900 bp  872  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0004  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 
2900 bp  892  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  87.92 
 
 
2907 bp  1223  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  87.92 
 
 
2907 bp  1223  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0008  23S ribosomal RNA  84.3 
 
 
2847 bp  684  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  87.52 
 
 
3129 bp  1019  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  87.52 
 
 
3129 bp  1019  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  87.52 
 
 
3129 bp  1019  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  87.52 
 
 
3129 bp  1019  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
3357 bp  1100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
3357 bp  1100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  85.69 
 
 
3298 bp  979  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  85.69 
 
 
3298 bp  979  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  85.69 
 
 
3298 bp  979  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  85.69 
 
 
3298 bp  979  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  91.61 
 
 
2908 bp  801  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2908 bp  1215  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  87.84 
 
 
2907 bp  1215  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  86.64 
 
 
2927 bp  1178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  91.59 
 
 
2943 bp  735  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  91.59 
 
 
2946 bp  735  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  91.41 
 
 
2946 bp  728  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  91.41 
 
 
2946 bp  728  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  91.41 
 
 
2944 bp  728  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  91.41 
 
 
2944 bp  728  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0058  23S ribosomal RNA  83.56 
 
 
3044 bp  753  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0033  23S ribosomal RNA  83.56 
 
 
3054 bp  753  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00342578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0007  23S ribosomal RNA  83.65 
 
 
3044 bp  761  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0002  23S ribosomal RNA  83.56 
 
 
3054 bp  753  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.407307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  87.86 
 
 
2933 bp  1181  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  87.86 
 
 
2933 bp  1181  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  88.03 
 
 
2932 bp  1197  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  87.94 
 
 
2935 bp  1189  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  88.03 
 
 
2933 bp  1197  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  87.86 
 
 
2933 bp  1181  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0010  23S ribosomal RNA  90.31 
 
 
2934 bp  1227  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0036  23S ribosomal RNA  90.61 
 
 
2934 bp  1251  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0042  23S ribosomal RNA  90.41 
 
 
2936 bp  1235  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  6.50821e-10 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  86.87 
 
 
2927 bp  1201  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 
2927 bp  1193  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 
2927 bp  1172  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  86.87 
 
 
2927 bp  1201  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 
2927 bp  1193  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>