74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0048 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0048  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  98.61 
 
 		 84 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  95.65 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0058  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0054  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000280744  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0024  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0008  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0263  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617224  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.074992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>