145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4960 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  37.96 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  36.19 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  38.95 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.19 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  34.34 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  31.86 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  37.96 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  37.96 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  32.43 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  32.43 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.31 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.25 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.31 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.5 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  34.55 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  28.07 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  33.63 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  31.25 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  35.64 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  37.62 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  29.09 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30.39 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  30.43 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  34.55 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30.39 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  30.91 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  36.73 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  28.04 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  31.76 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  30.21 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  33.04 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  38.71 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  28.32 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  26.55 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  27.97 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.23 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  31.4 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  28.57 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  68.75 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  29.41 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  32.71 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  41.27 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  28.32 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  28.57 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  27.1 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  34.92 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  35.94 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  35.48 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  37.1 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  31.63 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  33.01 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  32.05 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  22.41 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  25 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  29.73 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  35.48 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  30.53 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  29.73 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>