More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4936 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 96 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 96 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 96 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 96 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 176 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  93.6  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  44.44 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 93 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  36.84 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  37.93 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  39.13 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  36.78 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  35.56 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1526  ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.506351  normal  0.0309301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>