More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4931 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  295  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  57.82 
 
 
150 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  57.24 
 
 
148 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  53.79 
 
 
147 aa  154  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
148 aa  154  5e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
149 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  54.79 
 
 
149 aa  146  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  52.59 
 
 
150 aa  145  2e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  51.7 
 
 
147 aa  143  7e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
148 aa  143  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  48.98 
 
 
148 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  51.03 
 
 
148 aa  138  2e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 
151 aa  137  5e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.84 
 
 
159 aa  136  8e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 
151 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  48.28 
 
 
149 aa  135  3e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  51.02 
 
 
147 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  44.14 
 
 
148 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
147 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  42.57 
 
 
148 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  48.28 
 
 
147 aa  134  6e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  1e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.27696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 
147 aa  132  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  1e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.03383e-05  hitchhiker  1.47927e-09 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
151 aa  132  1e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.81135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  1e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 
147 aa  132  1e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  2e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.26689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  2e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  2e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  2e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.83517e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
148 aa  132  2e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  2e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  132  2e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  44.9 
 
 
146 aa  130  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  130  8e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
148 aa  130  8e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
151 aa  130  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  41.89 
 
 
148 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 
148 aa  129  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
150 aa  129  2e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
151 aa  128  2e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  5.08651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
151 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.97 
 
 
151 aa  127  5e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  127  5e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
149 aa  127  5e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  52.03 
 
 
148 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  46.85 
 
 
148 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 
148 aa  125  1e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
149 aa  125  1e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 
148 aa  125  1e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
151 aa  125  2e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  125  2e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
153 aa  125  2e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
148 aa  124  4e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
160 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  44.97 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  43.84 
 
 
149 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  42.95 
 
 
151 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  47.92 
 
 
148 aa  120  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  40.14 
 
 
149 aa  120  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
171 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  42.47 
 
 
151 aa  119  1e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  53.79 
 
 
147 aa  119  1e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  50.69 
 
 
148 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  50.69 
 
 
148 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
149 aa  116  1e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
149 aa  116  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 
149 aa  116  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 
149 aa  115  1e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 
149 aa  115  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  115  2e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
149 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  6.51865e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
165 aa  114  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  114  4e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  40.69 
 
 
148 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
168 aa  114  7e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 
154 aa  113  8e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  2.09307e-05 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  47.62 
 
 
150 aa  112  1e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  39.6 
 
 
151 aa  112  1e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
151 aa  113  1e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  40 
 
 
172 aa  112  2e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.22973e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  44.97 
 
 
149 aa  112  2e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  40.14 
 
 
157 aa  112  2e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
146 aa  112  2e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  40.14 
 
 
152 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  40.97 
 
 
151 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
167 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  42 
 
 
150 aa  111  4e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
151 aa  111  4e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
193 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
168 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
167 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  43.15 
 
 
149 aa  110  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
189 aa  109  1e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>