289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4914 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
160 aa  323  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  57.5 
 
 
177 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  184  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  184  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  54.09 
 
 
159 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  177  5e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  177  5e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  177  5e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  177  5e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  177  5e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  177  5e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
159 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
167 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
167 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  172  2e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  171  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  170  6e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 
159 aa  170  7e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 
159 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  49.69 
 
 
159 aa  164  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  164  6e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  163  7e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  163  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  49.69 
 
 
159 aa  162  2e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 
159 aa  162  2e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  161  4e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  49.69 
 
 
159 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  159  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  45.91 
 
 
159 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  48.12 
 
 
160 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 
159 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 
159 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
159 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  44.38 
 
 
160 aa  155  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  45.57 
 
 
159 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  47.5 
 
 
160 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  49.06 
 
 
165 aa  154  5e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 
159 aa  150  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  45 
 
 
156 aa  144  4e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  45 
 
 
160 aa  144  4e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  45.28 
 
 
158 aa  140  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  40.99 
 
 
154 aa  134  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  42.24 
 
 
155 aa  127  5e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.20768e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  44.03 
 
 
153 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  43.4 
 
 
153 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  36.48 
 
 
159 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 
157 aa  121  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  42.77 
 
 
153 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  35.67 
 
 
159 aa  121  5e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  39.24 
 
 
157 aa  120  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
155 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  41.88 
 
 
150 aa  120  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
155 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
155 aa  119  1e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  119  1e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
155 aa  119  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  43.4 
 
 
153 aa  120  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
155 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 
157 aa  117  4e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
155 aa  118  4e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
155 aa  117  5e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
156 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.32782e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
155 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 
155 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.21376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  39.49 
 
 
154 aa  116  1e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
155 aa  115  2e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
157 aa  115  2e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  37.11 
 
 
155 aa  115  2e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  38.99 
 
 
155 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.37083e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
155 aa  114  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 
152 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
157 aa  114  7e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  37.11 
 
 
156 aa  114  8e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  39.87 
 
 
154 aa  113  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  113  1e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.36055e-08  unclonable  3.93257e-11 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  112  2e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.27435e-06  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
166 aa  112  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  112  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.16859e-08  decreased coverage  2.22893e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  112  2e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.78909e-07  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  112  2e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.1317e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 
156 aa  112  2e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
155 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.27948e-07  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.90967e-05  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  111  4e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.70066e-09  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  111  4e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  111  4e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.54968e-07  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 
156 aa  111  4e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  40.26 
 
 
148 aa  111  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  111  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  32.7 
 
 
156 aa  110  8e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  110  1e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.35521e-05  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  110  1e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  110  1e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56643e-10  hitchhiker  5.16486e-10 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
162 aa  110  1e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>