266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4879 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 162 aa  328  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  57.79 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  57.69 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  53.55 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  55.84 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  53.59 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  50.33 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  47.59 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  51.03 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  46.48 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  43.4 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  40.76 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  41.33 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.54 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  40.27 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  38.71 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  38.71 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  37.84 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  39.22 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  37.25 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  37.25 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  37.25 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  37.91 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  38.51 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  37.25 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  36.71 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  37.25 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  37.25 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  39.74 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  35.48 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  40.97 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  37.84 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 169 aa  97.1  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  37.25 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.87 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  36.13 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.18 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  35.53 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  39.81 
 
 		 112 aa  94  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  34.48 
 
 		 170 aa  93.6  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  36.18 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  37.16 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  34.87 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  36.51 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 		 158 aa  90.5  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  33.77 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  35.9 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  33.77 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  35.67 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  34.87 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  34.84 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  34.21 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  33.12 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  34.93 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  35.53 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  35.95 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  38.51 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  34.62 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  31.16 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  35.53 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  35.66 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  34.87 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  36.3 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  35.06 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  32.19 
 
 		 166 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  34.19 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  34.21 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  38.02 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  33.97 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  34.21 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  31.87 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  35.82 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  34.23 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  34.01 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  33.78 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  36.99 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  37.68 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>