More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4832 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  42.34 
 
 
285 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
283 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  37.72 
 
 
285 aa  198  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  39.66 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  38.21 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.35 
 
 
286 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  37.72 
 
 
279 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40.86 
 
 
284 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  43.01 
 
 
285 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  41.64 
 
 
282 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.31 
 
 
285 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  44.57 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.56 
 
 
284 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.57 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.31 
 
 
288 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.15 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.64 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.5 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.4 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.05 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  35.05 
 
 
283 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  35.05 
 
 
283 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  38.49 
 
 
297 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.05 
 
 
283 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  39.16 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.71 
 
 
283 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.54 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.21 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  34.71 
 
 
283 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  35.05 
 
 
283 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  34.71 
 
 
283 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  38.79 
 
 
286 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  38.85 
 
 
297 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.46 
 
 
286 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  34.71 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  36.73 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  41.54 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  40.67 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  38.62 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  42.32 
 
 
277 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  37.81 
 
 
287 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40.42 
 
 
287 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  35.66 
 
 
279 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.78 
 
 
321 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  42.11 
 
 
270 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  36.2 
 
 
297 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  32.99 
 
 
283 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.91 
 
 
297 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  40.67 
 
 
277 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.68 
 
 
297 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  39.56 
 
 
301 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.41 
 
 
295 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  37.19 
 
 
289 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  36.93 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  39.03 
 
 
283 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  32.47 
 
 
359 aa  166  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.09 
 
 
300 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  32.87 
 
 
285 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.35 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  35.11 
 
 
587 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.87 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  34.75 
 
 
587 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.49 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
291 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.2 
 
 
280 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.59 
 
 
299 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.63 
 
 
280 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  33.84 
 
 
288 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  36.19 
 
 
279 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  39.41 
 
 
283 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.95 
 
 
285 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.74 
 
 
287 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  37.97 
 
 
275 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  31.23 
 
 
361 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  37.59 
 
 
291 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  37.59 
 
 
283 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  39.27 
 
 
280 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.81 
 
 
314 aa  155  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  34.26 
 
 
288 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  36.71 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  37.27 
 
 
274 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  39.02 
 
 
275 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  39.78 
 
 
280 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.01 
 
 
289 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  36.69 
 
 
317 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  36.98 
 
 
281 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  37.37 
 
 
288 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  37 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  37.15 
 
 
325 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.53 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  35 
 
 
283 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.44 
 
 
313 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  40.82 
 
 
283 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.55 
 
 
291 aa  149  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  37.63 
 
 
275 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  33.71 
 
 
285 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>