More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4740 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  100 
 
 
377 aa  771    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  36.53 
 
 
375 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  36.51 
 
 
374 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  37.46 
 
 
377 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  36.1 
 
 
375 aa  232  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  33.85 
 
 
379 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  35.36 
 
 
379 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  31.4 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.11 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  34.4 
 
 
372 aa  212  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  31.66 
 
 
379 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  31.01 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  31.81 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  32.21 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  28.05 
 
 
441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  32.51 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  28.24 
 
 
431 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  30.75 
 
 
412 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  31.69 
 
 
399 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  28.65 
 
 
402 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  28.99 
 
 
404 aa  169  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  33.05 
 
 
404 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.27 
 
 
375 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  32.75 
 
 
309 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  57.5 
 
 
271 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.7 
 
 
301 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  26.18 
 
 
394 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  28.8 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  47.93 
 
 
541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  51.61 
 
 
456 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50 
 
 
453 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  52.42 
 
 
523 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  47.58 
 
 
455 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.9 
 
 
391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  50 
 
 
457 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  50.81 
 
 
459 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  30.42 
 
 
397 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  49.19 
 
 
392 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  48.39 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.31 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  53.39 
 
 
265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.12 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  45.97 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  48.39 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  49.19 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  42.68 
 
 
391 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  50.41 
 
 
529 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  50 
 
 
238 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  50.86 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  50.41 
 
 
490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.78 
 
 
274 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  42.96 
 
 
300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  50 
 
 
238 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  52.14 
 
 
415 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  34.04 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  29.45 
 
 
397 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  29.69 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  27.81 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.86 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  39.29 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  52.59 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  48 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.21 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  39.77 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  50.85 
 
 
324 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  48.87 
 
 
382 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  47.66 
 
 
308 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  50.4 
 
 
414 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  47.9 
 
 
229 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.72 
 
 
430 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  46.67 
 
 
460 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  39.1 
 
 
367 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  43.66 
 
 
300 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.28 
 
 
243 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  25.82 
 
 
469 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  47.86 
 
 
472 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  50 
 
 
340 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  51.72 
 
 
316 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  51.72 
 
 
290 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  50.42 
 
 
470 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  49.57 
 
 
323 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  51.28 
 
 
328 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  39.15 
 
 
402 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  34.62 
 
 
316 aa  123  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  46.77 
 
 
300 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  50.81 
 
 
452 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  22.98 
 
 
398 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  42.66 
 
 
414 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  47.01 
 
 
665 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  47.86 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  49.15 
 
 
233 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  45.6 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  48.74 
 
 
503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  50 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  50 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  49.12 
 
 
319 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  44.35 
 
 
460 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  27.87 
 
 
374 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  52.14 
 
 
697 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  52.1 
 
 
412 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>