More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4681 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  61.89 
 
 
499 aa  660    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  62.99 
 
 
496 aa  669    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  63.49 
 
 
499 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  65.18 
 
 
496 aa  669    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  61.22 
 
 
499 aa  651    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  64.02 
 
 
502 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  61.1 
 
 
510 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  68.7 
 
 
501 aa  692    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  63.39 
 
 
496 aa  666    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  64.55 
 
 
494 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  63.32 
 
 
501 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  62.78 
 
 
496 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  62.99 
 
 
496 aa  669    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  62.99 
 
 
496 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  64.3 
 
 
496 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  64.34 
 
 
494 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  73.43 
 
 
501 aa  772    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  63.32 
 
 
501 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  60.74 
 
 
498 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  64.01 
 
 
504 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  61.48 
 
 
499 aa  657    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  64.02 
 
 
502 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  65.37 
 
 
493 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  61.43 
 
 
501 aa  645    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  62.88 
 
 
500 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  66.8 
 
 
507 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  61.27 
 
 
505 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  60.74 
 
 
498 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  62.99 
 
 
496 aa  668    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  63.27 
 
 
503 aa  672    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  62.78 
 
 
496 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  100 
 
 
494 aa  1021    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  61.18 
 
 
513 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  61.76 
 
 
505 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  65.44 
 
 
505 aa  682    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  66.8 
 
 
507 aa  692    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  62.99 
 
 
505 aa  666    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  64.02 
 
 
502 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  64.96 
 
 
494 aa  674    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  64.07 
 
 
499 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  60.69 
 
 
497 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  64.62 
 
 
496 aa  686    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  60.66 
 
 
500 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  61.07 
 
 
500 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  64.01 
 
 
496 aa  681    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  64.02 
 
 
502 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  62.99 
 
 
496 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  64.75 
 
 
503 aa  680    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  61.07 
 
 
500 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  66.8 
 
 
507 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  62.78 
 
 
496 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  65.04 
 
 
495 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  64.02 
 
 
502 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  66.26 
 
 
500 aa  686    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  65.66 
 
 
500 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  64.02 
 
 
502 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  64.96 
 
 
494 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  64.75 
 
 
494 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  65.72 
 
 
495 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  64.43 
 
 
498 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  63.29 
 
 
505 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  63.11 
 
 
503 aa  669    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  63.67 
 
 
505 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  61.07 
 
 
500 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  64.34 
 
 
494 aa  671    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  63.29 
 
 
496 aa  663    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  66.6 
 
 
497 aa  706    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  61.07 
 
 
500 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  65.16 
 
 
494 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  63.6 
 
 
505 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  64.55 
 
 
502 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  63.08 
 
 
499 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  64.56 
 
 
498 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  64.9 
 
 
495 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  63.49 
 
 
499 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  62.65 
 
 
507 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  64.55 
 
 
494 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08090  glycerol kinase  62.78 
 
 
499 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000058898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  65.11 
 
 
507 aa  682    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  67.01 
 
 
498 aa  708    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  63.93 
 
 
503 aa  672    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  61.66 
 
 
498 aa  651    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  64.56 
 
 
505 aa  679    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  62.47 
 
 
501 aa  651    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  66.53 
 
 
507 aa  695    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  64.15 
 
 
494 aa  670    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  63.19 
 
 
496 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  64.55 
 
 
494 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  64.43 
 
 
502 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  61.71 
 
 
489 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  61.48 
 
 
503 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  61.48 
 
 
518 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>