More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4638 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
451 aa  904  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  61.17 
 
 
451 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  58.04 
 
 
455 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  57.37 
 
 
455 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  56.67 
 
 
459 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  57.11 
 
 
473 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  57.3 
 
 
474 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  57.3 
 
 
474 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  57.11 
 
 
474 aa  493  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  58.39 
 
 
472 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  58.39 
 
 
472 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  56.08 
 
 
478 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  55.86 
 
 
478 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  55.86 
 
 
478 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  56.08 
 
 
478 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  55.86 
 
 
478 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  55.86 
 
 
478 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  55.86 
 
 
478 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  56.5 
 
 
476 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  57.08 
 
 
473 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  55.98 
 
 
474 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  57.17 
 
 
467 aa  465  1e-130  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  50.79 
 
 
514 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  50.56 
 
 
457 aa  447  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  44.97 
 
 
509 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  54.7 
 
 
398 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  39.15 
 
 
447 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 
451 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  37.7 
 
 
438 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  38.64 
 
 
399 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  37.79 
 
 
399 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.23204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  36.85 
 
 
399 aa  287  3e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.14177e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  37.32 
 
 
399 aa  287  3e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.69498e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
399 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
399 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.22558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
399 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
399 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.80591e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
399 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.59613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  37.32 
 
 
399 aa  285  1e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.05464e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  37.09 
 
 
399 aa  285  1e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.25853e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  35.2 
 
 
459 aa  284  3e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 
456 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
398 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.76 
 
 
485 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
398 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.27195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 
473 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.62 
 
 
468 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.98546e-05  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.47 
 
 
477 aa  269  6e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
465 aa  270  6e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
435 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
459 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
447 aa  255  1e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
470 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 
445 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  33.04 
 
 
456 aa  246  5e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
438 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  33.33 
 
 
526 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.66 
 
 
449 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
404 aa  236  5e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  33.77 
 
 
460 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  32.96 
 
 
438 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  34.14 
 
 
463 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  32.74 
 
 
437 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.06 
 
 
450 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
488 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.62 
 
 
487 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
461 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.1 
 
 
479 aa  223  5e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.1 
 
 
479 aa  223  5e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 
473 aa  221  2e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.83 
 
 
472 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.33 
 
 
436 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  32.39 
 
 
472 aa  219  9e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  32.17 
 
 
475 aa  219  9e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  32.97 
 
 
478 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.96 
 
 
475 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  32.39 
 
 
472 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  32.39 
 
 
472 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.08 
 
 
468 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  32.39 
 
 
472 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  32.76 
 
 
436 aa  215  1e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
466 aa  215  1e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.6 
 
 
464 aa  215  1e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  32.76 
 
 
436 aa  215  1e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  32.46 
 
 
472 aa  214  2e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  32.31 
 
 
492 aa  214  3e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  32.87 
 
 
415 aa  213  4e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  32.62 
 
 
437 aa  213  8e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
472 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
467 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  32.3 
 
 
479 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  32.24 
 
 
472 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  31.65 
 
 
479 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.56 
 
 
462 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
472 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
479 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
472 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.56 
 
 
462 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  32.03 
 
 
472 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  32.91 
 
 
436 aa  210  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>