More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4614 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  100 
 
 
129 aa  263  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  46 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.71 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.5 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.59 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 
282 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.6 
 
 
383 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.74 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.43 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  41.24 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  35.96 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.47 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  40.21 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  41.33 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  35.19 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  34.4 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.54 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  40.21 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.44 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  43.62 
 
 
369 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  39.44 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.72 
 
 
813 aa  67  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 
278 aa  66.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  36.28 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  45.57 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  45.33 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.6 
 
 
567 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  39.78 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  34.48 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.36 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  39.78 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  39.78 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
561 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  37.96 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
323 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.66 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 
271 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.29 
 
 
383 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.27 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 
216 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  34.48 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  39.8 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
558 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 
269 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
393 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
120 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  37.63 
 
 
186 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.25 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.23 
 
 
392 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  36.73 
 
 
389 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  42.86 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  33.77 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  36.62 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>