More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4606 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4606  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  100 
 
 
256 aa  510  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1019  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  74.22 
 
 
256 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0572  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  57.25 
 
 
256 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.118411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0311  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  56.47 
 
 
256 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3230  putative electron transfer flavoprotein FixA  55.25 
 
 
257 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1945  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.73 
 
 
254 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.186501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1914  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.73 
 
 
254 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1900  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.73 
 
 
254 aa  262  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2677  putative electron transfer flavoprotein FixA  54.47 
 
 
257 aa  262  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1498  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.33 
 
 
254 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2873  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  51.37 
 
 
255 aa  261  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1934  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.33 
 
 
254 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01666  hypothetical protein  52.55 
 
 
254 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2414  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.94 
 
 
254 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01655  hypothetical protein  52.55 
 
 
254 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1450  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.55 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.335905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1818  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.55 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1395  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  56.08 
 
 
254 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1484  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.16 
 
 
254 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0299245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1990  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.16 
 
 
254 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1466  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.16 
 
 
254 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.2749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4039  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.14 
 
 
257 aa  248  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0084  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.33 
 
 
256 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.33 
 
 
256 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.12 
 
 
256 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.33 
 
 
256 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0085  putative electron transfer flavoprotein FixA  51.56 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0043  putative electron transfer flavoprotein FixA  51.95 
 
 
256 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570899  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  51.56 
 
 
277 aa  228  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00045  predicted electron transfer flavoprotein subunit, ETFP adenine nucleotide-binding domain protein  51.56 
 
 
256 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3558  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.56 
 
 
256 aa  228  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  51.56 
 
 
256 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3614  putative electron transfer flavoprotein FixA  51.56 
 
 
256 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0047  putative electron transfer flavoprotein FixA  51.56 
 
 
256 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00044  hypothetical protein  51.56 
 
 
256 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1824  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44.53 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.096879  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.68 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.315122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.26 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0267  electron transfer flavoprotein beta subunit-like protein  44.28 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08790  electron transfer flavoprotein, beta subunit  47.03 
 
 
247 aa  163  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.515982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3104  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.26 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09230  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.32 
 
 
251 aa  158  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02670  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.39 
 
 
256 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  38.98 
 
 
251 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.09 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0331  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.86 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.63 
 
 
256 aa  126  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.55 
 
 
262 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.68 
 
 
257 aa  122  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.62 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0577  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.41 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.08 
 
 
278 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.68 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  31.06 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.27 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.06 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.65 
 
 
261 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.47 
 
 
610 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.54 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.62 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.87 
 
 
259 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.91 
 
 
262 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.8 
 
 
258 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.33 
 
 
258 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.02 
 
 
259 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.69 
 
 
257 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.1 
 
 
259 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0429  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.64 
 
 
249 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0572448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.2 
 
 
264 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.96 
 
 
257 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1368  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.96 
 
 
283 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.3 
 
 
267 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.89 
 
 
251 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.79 
 
 
257 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  28.02 
 
 
257 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  28.02 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  28.02 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  28.02 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.85 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  28.02 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  28.02 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4258  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  28.02 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0657  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.18 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.553142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3687  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.06 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  31.46 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.17 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.74 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.94 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.49 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2067  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.8 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107752  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  27.63 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.3 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  27.63 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  28.63 
 
 
601 aa  95.5  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1211  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.04 
 
 
270 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.8 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2872  electron transfer flavoprotein  29.64 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.604288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.18 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  27.84 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.51 
 
 
266 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>