More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4590 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 
577 aa  1175    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
585 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  29.64 
 
 
569 aa  250  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  24.55 
 
 
597 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  30.7 
 
 
595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  37.94 
 
 
488 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  33.76 
 
 
603 aa  191  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  27.34 
 
 
567 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  37.2 
 
 
516 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  24.75 
 
 
597 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  27.8 
 
 
589 aa  180  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  34.73 
 
 
604 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  34.13 
 
 
603 aa  161  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  33.7 
 
 
594 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  32.85 
 
 
583 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  25.21 
 
 
633 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  31.07 
 
 
583 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  30.82 
 
 
495 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  30.61 
 
 
600 aa  153  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  36.65 
 
 
414 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  26.03 
 
 
627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  33.83 
 
 
600 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  35.17 
 
 
604 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  30.89 
 
 
612 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  33.21 
 
 
610 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  23.79 
 
 
599 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
576 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
502 aa  143  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  30.53 
 
 
574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  40 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  29.78 
 
 
600 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  38.86 
 
 
465 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.84 
 
 
498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  38.94 
 
 
575 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  36.41 
 
 
563 aa  137  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
483 aa  137  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  34.2 
 
 
446 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 
400 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  34.38 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  37.89 
 
 
561 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.75 
 
 
607 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  28.01 
 
 
564 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  36.82 
 
 
561 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
561 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
561 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
561 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
561 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
561 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  31.01 
 
 
587 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  36.82 
 
 
561 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 
561 aa  133  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  35.85 
 
 
431 aa  133  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  36.82 
 
 
561 aa  133  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  36.82 
 
 
561 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  28.54 
 
 
574 aa  133  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 
561 aa  133  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  36.82 
 
 
561 aa  133  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  34.82 
 
 
408 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  36.82 
 
 
561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  36.54 
 
 
563 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  38.99 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  32.41 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  30.26 
 
 
594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  34.01 
 
 
397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  37.02 
 
 
577 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
561 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  35.82 
 
 
562 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  34.09 
 
 
394 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  37.84 
 
 
556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  34.93 
 
 
565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 
559 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 
411 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  36.15 
 
 
391 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 
568 aa  127  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  36.22 
 
 
556 aa  127  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  25.27 
 
 
623 aa  127  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  35.27 
 
 
561 aa  126  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  34.66 
 
 
398 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  32.23 
 
 
576 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  34.27 
 
 
450 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 
565 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  35.86 
 
 
561 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
565 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  33.88 
 
 
576 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  35.48 
 
 
394 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
410 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 
557 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  35.09 
 
 
394 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  35.15 
 
 
559 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  32.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  34.4 
 
 
374 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  29.1 
 
 
581 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  35.02 
 
 
403 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 
491 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  35.45 
 
 
572 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  32.55 
 
 
578 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  32.55 
 
 
578 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 
572 aa  124  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>