More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4586 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 250 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  70.16 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  72.06 
 
 		 250 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  71.26 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  68.67 
 
 		 250 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  68 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  68.15 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  66 
 
 		 252 aa  364  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  68.27 
 
 		 251 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  66 
 
 		 252 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  64.4 
 
 		 252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  64.4 
 
 		 252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  64.4 
 
 		 252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  64.4 
 
 		 252 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  64 
 
 		 252 aa  354  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  65.59 
 
 		 249 aa  354  6.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  64.4 
 
 		 252 aa  353  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  65.18 
 
 		 249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  63.56 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  62.65 
 
 		 257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  60.16 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  57.69 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  60.47 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  58.8 
 
 		 259 aa  305  3e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  50.88 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  55.38 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  54.44 
 
 		 255 aa  289  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  51.81 
 
 		 268 aa  278  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  50.2 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  50.2 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  50.6 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  48.41 
 
 		 257 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.41 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  48.61 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  49.01 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  47.83 
 
 		 336 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  46.25 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  45.85 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  48.44 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  50.59 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  49.01 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  46.06 
 
 		 262 aa  235  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  45.24 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  49.01 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  49.01 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  45.93 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  44.88 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  46.27 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  43.9 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  47.04 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  46.64 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  47.06 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  45.49 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  44.02 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  45.06 
 
 		 259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  43.18 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  42.29 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  42.29 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  41.76 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  43.03 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  42.13 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  44.09 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  44.16 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.59 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  41.5 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  41.37 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  41.24 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.84 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  40.86 
 
 		 285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  42.65 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  38.1 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.1 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  38.1 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  37.7 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  40.32 
 
 		 270 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  41.67 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  37.3 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  37.3 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.74 
 
 		 258 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.3 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  39.23 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.86 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  37.3 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  39.37 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>