More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4564 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
411 aa  846    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  77.56 
 
 
409 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.48 
 
 
410 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  64.23 
 
 
410 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.36 
 
 
409 aa  562  1.0000000000000001e-159  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.99 
 
 
410 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.75 
 
 
410 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.5 
 
 
410 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.41 
 
 
410 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.5 
 
 
410 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.53 
 
 
411 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.77 
 
 
411 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  60.84 
 
 
411 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.73 
 
 
411 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.34 
 
 
411 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.89 
 
 
407 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.71 
 
 
407 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  59.85 
 
 
411 aa  522  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.58 
 
 
411 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.58 
 
 
411 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.85 
 
 
411 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.61 
 
 
408 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.87 
 
 
408 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.1 
 
 
408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.56 
 
 
411 aa  512  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.61 
 
 
408 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  59.31 
 
 
408 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.74 
 
 
404 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.98 
 
 
407 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.29 
 
 
411 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.87 
 
 
408 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.87 
 
 
408 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.6 
 
 
408 aa  501  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.82 
 
 
408 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.39 
 
 
409 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.35 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.39 
 
 
531 aa  475  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.39 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.14 
 
 
424 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  45.12 
 
 
443 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  40.55 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40 
 
 
393 aa  300  3e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
386 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  30.62 
 
 
388 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.86 
 
 
387 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.26 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.02 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.47 
 
 
389 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 
389 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.21 
 
 
388 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  26.92 
 
 
390 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.8 
 
 
391 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.71 
 
 
388 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  28.18 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.78 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  28.4 
 
 
382 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  29.38 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.04 
 
 
385 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29.1 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.81 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  28.97 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 
398 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  28.47 
 
 
394 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  27.68 
 
 
384 aa  123  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  26.43 
 
 
388 aa  123  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.5 
 
 
385 aa  122  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  28.26 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  25.85 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  28.08 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  24.5 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  25.94 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  26.49 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  28.47 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  27.34 
 
 
387 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  26.89 
 
 
401 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  28.89 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  28.89 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  29.14 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  27.97 
 
 
382 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  28.82 
 
 
402 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  26.87 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  26.8 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  26.11 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  28.99 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  27.02 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  25.36 
 
 
392 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  25.88 
 
 
390 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  27.37 
 
 
411 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  27.15 
 
 
388 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.47 
 
 
392 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  28.21 
 
 
412 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  25.25 
 
 
393 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  24.64 
 
 
392 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  26.34 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  27.95 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  26.85 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.4 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  26.85 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>