More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4554 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4554  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 
331 aa  691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.24 
 
 
820 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2071  hypothetical protein  38.11 
 
 
512 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2061  hypothetical protein  37.68 
 
 
512 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.97 
 
 
769 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.51 
 
 
994 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.47 
 
 
481 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.22 
 
 
481 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.41 
 
 
407 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.87 
 
 
710 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4702  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.45 
 
 
464 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781083  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.03 
 
 
424 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  30.67 
 
 
703 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  43.43 
 
 
611 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.58 
 
 
550 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  31.49 
 
 
420 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  43.98 
 
 
459 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5857  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.85 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  47.4 
 
 
307 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  44.17 
 
 
681 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.64 
 
 
419 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.14 
 
 
827 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
680 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2063  diguanylate cyclase  34.44 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553076  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.45 
 
 
769 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5174  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.65 
 
 
703 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.54 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  46.25 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  43.31 
 
 
498 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2111  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
392 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.75 
 
 
763 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.62 
 
 
315 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.33 
 
 
306 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.78 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2499  GGDEF domain-containing protein  44.39 
 
 
367 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1907  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
487 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  34.62 
 
 
425 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.16 
 
 
587 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0242812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0754  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.5 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.01 
 
 
314 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  31.39 
 
 
659 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.76 
 
 
309 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2194  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.91 
 
 
636 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 
308 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  33.58 
 
 
428 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  46.71 
 
 
624 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  34.18 
 
 
418 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  46.67 
 
 
471 aa  135  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.35 
 
 
929 aa  135  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.59 
 
 
578 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  32.04 
 
 
548 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.86 
 
 
1000 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.38 
 
 
564 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0963  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.52 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3092  diguanylate cyclase  45.22 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2914  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.79 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.89 
 
 
921 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227976  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.09 
 
 
791 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  43.58 
 
 
565 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  44.32 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.2 
 
 
935 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2824  GGDEF domain-containing protein  40.56 
 
 
628 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.1 
 
 
1078 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  29.74 
 
 
498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.87 
 
 
304 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.04 
 
 
469 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  43.31 
 
 
525 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2926  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.66 
 
 
461 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000284142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  35.24 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1251  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.57 
 
 
921 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1751  diguanylate cyclase  45.24 
 
 
389 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1161  diguanylate cyclase  46.45 
 
 
440 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0876222  normal  0.647833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30 
 
 
1466 aa  133  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1329  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.57 
 
 
921 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  45.12 
 
 
477 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  30.58 
 
 
667 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3185  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.91 
 
 
482 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  44.64 
 
 
474 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4055  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.79 
 
 
1052 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2091  diguanylate cyclase  38.69 
 
 
325 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  39.29 
 
 
641 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  33.09 
 
 
768 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.45 
 
 
1125 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.88 
 
 
314 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  44.64 
 
 
396 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.87 
 
 
792 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3066  GGDEF domain-containing protein  40 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2880  GGDEF  45.16 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.16195  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3770  PAS:GGDEF  31.99 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0223226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  45.96 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1551  GGDEF domain-containing protein  40 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1222  GGDEF domain-containing protein  40 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1449  diguanylate cyclase  40 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2101  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  33.79 
 
 
849 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  40.11 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0508  GGDEF domain-containing protein  40 
 
 
454 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  37.07 
 
 
354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1418  diguanylate cyclase  40 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.32 
 
 
867 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.81451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  42.51 
 
 
492 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>