148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4552 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  64.78 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  47.65 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  48.76 
 
 		 329 aa  248  7e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  46.44 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  49.16 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  47.62 
 
 		 315 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  48.63 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  45.16 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  47.44 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  43.87 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.83 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  41.61 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  50 
 
 		 640 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  41.61 
 
 		 317 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.36 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.25 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 292 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.51 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  43.45 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  45.49 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.83 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  43.45 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  42.14 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  42.33 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  42.8 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  37.01 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  48.23 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40 
 
 		 584 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  50.98 
 
 		 120 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  25.86 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  27.93 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  29 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  27.31 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  28.5 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  27 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  26.82 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  24.78 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  26.51 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  26.64 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  25.52 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  25.6 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  29.02 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  27.93 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  28.26 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  26.74 
 
 		 425 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>