124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4476 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
570 aa  1142    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  44.22 
 
 
600 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  49.13 
 
 
326 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  43.29 
 
 
795 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  42.47 
 
 
640 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  40 
 
 
637 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.88 
 
 
649 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.92 
 
 
706 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.39 
 
 
749 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  36.21 
 
 
688 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  34.82 
 
 
538 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.29 
 
 
619 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.01 
 
 
769 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.5 
 
 
860 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  35.62 
 
 
1550 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.31 
 
 
871 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.8 
 
 
1045 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.97 
 
 
2884 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  33.33 
 
 
600 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.89 
 
 
543 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  33.71 
 
 
1037 aa  138  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.69 
 
 
962 aa  136  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.13 
 
 
905 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.68 
 
 
1073 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.14 
 
 
885 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  32.18 
 
 
1192 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  34.31 
 
 
1452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.44 
 
 
530 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  36.19 
 
 
1916 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.17 
 
 
1412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  31.46 
 
 
998 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.58 
 
 
1821 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.63 
 
 
847 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  30.03 
 
 
848 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  30.12 
 
 
589 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  31.45 
 
 
442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  30.63 
 
 
682 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  33.92 
 
 
1312 aa  118  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.43 
 
 
600 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.61 
 
 
510 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  32.22 
 
 
1300 aa  115  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  32.59 
 
 
976 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  33.21 
 
 
4630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.27 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.76 
 
 
342 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  29.66 
 
 
554 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.71 
 
 
624 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.7 
 
 
448 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.41 
 
 
684 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.46 
 
 
833 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.9 
 
 
386 aa  104  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.05 
 
 
1135 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.04 
 
 
719 aa  98.2  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.95 
 
 
551 aa  97.1  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  30.07 
 
 
661 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.3 
 
 
600 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.78 
 
 
688 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  30.38 
 
 
635 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  43.56 
 
 
437 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  28.84 
 
 
643 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  28.85 
 
 
841 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 
475 aa  94  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  38.73 
 
 
1009 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  29.8 
 
 
714 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.52 
 
 
1059 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.99 
 
 
656 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  24.52 
 
 
627 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.91 
 
 
635 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  26.67 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  33.48 
 
 
981 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  26.61 
 
 
667 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.83 
 
 
663 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  35.76 
 
 
1937 aa  77  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  35.76 
 
 
1467 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  30.99 
 
 
297 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  37.7 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  25.67 
 
 
678 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  30.83 
 
 
1279 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  38.55 
 
 
1048 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  28.99 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  31.64 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  38.26 
 
 
526 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  36.75 
 
 
2638 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  31.1 
 
 
390 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  31.78 
 
 
673 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  36.17 
 
 
2392 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  48.19 
 
 
1732 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  39.62 
 
 
556 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  36.21 
 
 
330 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  34.8 
 
 
2042 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  45 
 
 
306 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  37.68 
 
 
462 aa  57.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  33.87 
 
 
1141 aa  57  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  27.62 
 
 
1831 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0548  hypothetical protein  25.58 
 
 
398 aa  55.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  30.13 
 
 
554 aa  54.3  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  32.89 
 
 
983 aa  53.9  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  39.76 
 
 
942 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  36.71 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  27.62 
 
 
605 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>