95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4365 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
229 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  26.29 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1645  cotJC protein  29.93 
 
 
171 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  24.38 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.14 
 
 
75 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.59 
 
 
389 aa  52.4  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  25.44 
 
 
276 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  25.15 
 
 
230 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  24.39 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.48 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  28.93 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 
130 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  39.22 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  23.39 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  24.57 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93619  predicted protein  34.62 
 
 
684 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.905914 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94160  predicted protein  34.62 
 
 
684 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.876416  normal  0.0540257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  30.7 
 
 
304 aa  48.9  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  45.83 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
192 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  24.28 
 
 
190 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  25.75 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  43.9 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  38.98 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1557  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
517 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.29 
 
 
382 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  25.58 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  31.46 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.22 
 
 
335 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.29 
 
 
382 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 
590 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  24.86 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.92 
 
 
797 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 
175 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  24.86 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 
507 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  36.36 
 
 
291 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  44.19 
 
 
522 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2576  stage VI sporulation protein D  41.86 
 
 
431 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  38.46 
 
 
426 aa  45.1  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  43.9 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  43.9 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.04 
 
 
415 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 
567 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.78 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  34.04 
 
 
500 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  43.9 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.73 
 
 
354 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  40.91 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  25.67 
 
 
326 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  38.3 
 
 
788 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  44.19 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  28.57 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  40.43 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  45.65 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  25.3 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  34.78 
 
 
520 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 
709 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  46.81 
 
 
546 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  40.91 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 
390 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  41.46 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  26.57 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 
446 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  24.16 
 
 
293 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  36.17 
 
 
409 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  26.98 
 
 
421 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  34.85 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  33.78 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  40 
 
 
328 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  40 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  35.42 
 
 
526 aa  42.4  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  37.5 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  25.28 
 
 
294 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 
539 aa  42.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  32.84 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 
519 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  43.9 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 
168 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  26.32 
 
 
538 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  38 
 
 
212 aa  42  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  37.78 
 
 
128 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  45.45 
 
 
261 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
368 aa  42  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  39.06 
 
 
199 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  26.09 
 
 
530 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1083  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38 
 
 
506 aa  41.6  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.91418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  28.99 
 
 
171 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>