More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4300 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  48.09 
 
 
192 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  47.65 
 
 
226 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  49.71 
 
 
231 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  44.91 
 
 
204 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  48.41 
 
 
192 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  49.35 
 
 
208 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
192 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  48.41 
 
 
188 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
188 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
188 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  51.35 
 
 
213 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
188 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
188 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
188 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
188 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 
188 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  47.13 
 
 
198 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  48.67 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  48.73 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  46.2 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  47.5 
 
 
225 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  49.33 
 
 
195 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  50.38 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  42.57 
 
 
181 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  42.86 
 
 
225 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  40.7 
 
 
210 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  39.8 
 
 
208 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  39.8 
 
 
208 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  45.8 
 
 
198 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  44.58 
 
 
242 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.81 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  40.96 
 
 
217 aa  131  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  42.66 
 
 
191 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  45.59 
 
 
224 aa  128  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  40.76 
 
 
181 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  42.04 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  42.04 
 
 
246 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  42.67 
 
 
248 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  42.95 
 
 
175 aa  124  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  40.72 
 
 
274 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  40.13 
 
 
184 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  41.57 
 
 
210 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  46.56 
 
 
189 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.6 
 
 
207 aa  121  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  44.53 
 
 
178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  43.08 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  41.88 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  42.76 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 
239 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  36.27 
 
 
199 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  43.79 
 
 
202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  41.03 
 
 
181 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  40 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  44.9 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.75 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.22 
 
 
260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  36.67 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  42.28 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  37.22 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  36.67 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  33.93 
 
 
244 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  44.19 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  35.75 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  42.22 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  34.78 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  38.71 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  41.61 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 
196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 
196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 
250 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 
196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  43.61 
 
 
201 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 
207 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 
241 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  36.61 
 
 
197 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  41.03 
 
 
162 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  41.61 
 
 
172 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  36.6 
 
 
286 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
247 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  34.5 
 
 
197 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
197 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
196 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
197 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
197 aa  111  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  34.5 
 
 
197 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
197 aa  111  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  34.32 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 
237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  35.91 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  35.32 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  35.93 
 
 
187 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>