263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4254 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.9 
 
 
698 aa  643    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  49.2 
 
 
695 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
690 aa  1400    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.83 
 
 
694 aa  622  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.67 
 
 
690 aa  595  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  43.6 
 
 
688 aa  567  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.76 
 
 
693 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  42.3 
 
 
688 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.97 
 
 
687 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.97 
 
 
687 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.66 
 
 
690 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.77 
 
 
691 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.94 
 
 
688 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.28 
 
 
686 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.04 
 
 
687 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.69 
 
 
687 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.71 
 
 
679 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.7 
 
 
673 aa  488  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.11 
 
 
687 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40 
 
 
686 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.48 
 
 
728 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.4 
 
 
711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.4 
 
 
711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.29 
 
 
705 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.61 
 
 
687 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.18 
 
 
694 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.17 
 
 
691 aa  463  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.32 
 
 
688 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.32 
 
 
689 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.58 
 
 
678 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.88 
 
 
716 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.88 
 
 
685 aa  450  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  39.05 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  39.32 
 
 
694 aa  447  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.51 
 
 
680 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.72 
 
 
696 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.43 
 
 
719 aa  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  37.93 
 
 
700 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.19 
 
 
689 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.46 
 
 
696 aa  438  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.37 
 
 
690 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.58 
 
 
701 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.78 
 
 
668 aa  426  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.6 
 
 
693 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.65 
 
 
695 aa  420  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  36.93 
 
 
688 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  35.69 
 
 
696 aa  419  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.42 
 
 
693 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.13 
 
 
701 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  36.93 
 
 
696 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.94 
 
 
684 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.36 
 
 
701 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.88 
 
 
696 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.14 
 
 
702 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.36 
 
 
684 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  37.16 
 
 
688 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.51 
 
 
684 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.73 
 
 
684 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.21 
 
 
733 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.59 
 
 
688 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.58 
 
 
697 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1092  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.53 
 
 
689 aa  409  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  35.95 
 
 
694 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  36.01 
 
 
729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.65 
 
 
731 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.08 
 
 
685 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.52 
 
 
688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.21 
 
 
689 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.02 
 
 
685 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.79 
 
 
693 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.34 
 
 
701 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.12 
 
 
688 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.73 
 
 
684 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.5 
 
 
684 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.63 
 
 
689 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  36.02 
 
 
688 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.86 
 
 
692 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  34.69 
 
 
672 aa  399  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.35 
 
 
683 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.16 
 
 
672 aa  395  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.35 
 
 
683 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.26 
 
 
689 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.57 
 
 
689 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.24 
 
 
689 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.64 
 
 
684 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.57 
 
 
692 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  37.65 
 
 
991 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.49 
 
 
688 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.29 
 
 
689 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.37 
 
 
678 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  34.47 
 
 
690 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.56 
 
 
694 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.7 
 
 
697 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.91 
 
 
693 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.06 
 
 
688 aa  389  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.63 
 
 
993 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  35.63 
 
 
696 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.76 
 
 
689 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  35.16 
 
 
693 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>