24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4178 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4178  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 440 aa  900    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3341  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0022  hypothetical protein  21.89 
 
 		 336 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1476  Radical SAM domain protein  24.9 
 
 		 312 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5065  hypothetical protein  22.87 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1780  hypothetical protein  20.72 
 
 		 292 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5689  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  27.69 
 
 		 310 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6312  hypothetical protein  21.69 
 
 		 292 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.668118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1767  hypothetical protein  21.69 
 
 		 292 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.5 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  28.7 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  30.3 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 332 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1702  hypothetical protein  21.69 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0534868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.27 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  25.84 
 
 		 340 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.49 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.21 
 
 		 323 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 323 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>