More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4120 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  100 
 
 
151 aa  291  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000127849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  43.45 
 
 
163 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  41.56 
 
 
189 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  39.73 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  39.73 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  38.06 
 
 
167 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.99 
 
 
165 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.89 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.6 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.36 
 
 
168 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.6 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  35.62 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  38.51 
 
 
168 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.82 
 
 
158 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  35.37 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  40.41 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  36.18 
 
 
183 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.55 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  34 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.53 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  39.04 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  41.13 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  34.67 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  35.62 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.13 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  41.13 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.24 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  36.17 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.76 
 
 
169 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.76 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  38.81 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.18 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  37.59 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  40.6 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  34.67 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  34.67 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.62 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.18 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  36.42 
 
 
192 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.89 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  35.9 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.33 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  35.9 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  36.42 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  35.62 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  35.03 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  33.55 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  34.48 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  33.55 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  32.64 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.97 
 
 
518 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  35.76 
 
 
194 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  35.17 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  33.55 
 
 
162 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.39 
 
 
185 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  33.97 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  31.76 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  32.45 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  33.55 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.25 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  33.33 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  33.33 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  30.52 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.04 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  32.72 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.89 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  35.81 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  33.57 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  33.99 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.89 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  33.33 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.47 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  29.87 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  41.44 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  29.87 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  29.87 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  29.87 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.58 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.58 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  32.26 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.58 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.58 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.58 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.58 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  30.52 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.88 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  30.52 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.89 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  38.46 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  33.55 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  30.77 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  35.14 
 
 
520 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.24 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  40.8 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  34.44 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>