More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4054 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  76.47 
 
 		 241 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  81.36 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  82.33 
 
 		 243 aa  355  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  74.27 
 
 		 239 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  78.5 
 
 		 239 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  73.42 
 
 		 239 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  74.46 
 
 		 239 aa  338  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  71.85 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  77.1 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  73.3 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  74.65 
 
 		 243 aa  331  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  77.57 
 
 		 241 aa  331  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  70.87 
 
 		 239 aa  327  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 241 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  75.23 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  68.14 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  68.14 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  69.44 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  71.03 
 
 		 245 aa  301  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  66.06 
 
 		 246 aa  297  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  60.26 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  51.94 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  50.72 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.24 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  50.72 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  48.7 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  51.28 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  50.49 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 		 232 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  41.92 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  46.23 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  45.75 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  45.05 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  46.97 
 
 		 239 aa  188  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  43.72 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  45.24 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  48.45 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  54.96 
 
 		 149 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  61.54 
 
 		 114 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  32.31 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  33.59 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  33.59 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  32.95 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  31.37 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  54.84 
 
 		 118 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  30.53 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  33.46 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  45.13 
 
 		 118 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  41.53 
 
 		 126 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  31.85 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3369  RpoD family RNA polymerase sigma factor  31.5 
 
 		 353 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.453528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  31.54 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  31.92 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.47 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  31.45 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  32.38 
 
 		 273 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  31.85 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  31.6 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  31.54 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.47 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  32.44 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  33.2 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.51 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.19 
 
 		 232 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  33.07 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0975  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.97 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000391946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4408  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.76 
 
 		 347 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2095  RNA polymerase sigma factor RpoS  28.96 
 
 		 391 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2115  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.3 
 
 		 386 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213085  normal  0.555888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  33.05 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1358  RNA polymerase, sigma 28 subunit  32.1 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  30.08 
 
 		 358 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>