51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4027 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 275 aa  568  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  26.55 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.75 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  24.67 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  36.52 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  26.26 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  22.75 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.6 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.6 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  26.32 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.6 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.08 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.68 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  23.94 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  24.72 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  28.73 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.05 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  24.41 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  28.57 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  25.75 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  29.94 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.33 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  25.61 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.54 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.35 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.95 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  28.57 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  29.8 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  23.66 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  22.62 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  27.47 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.61 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  22.51 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.13 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  25.32 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.33 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.79 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.1 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  31.06 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.15 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.14 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  25.2 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.27 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.79 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  27.55 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>