51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3926 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  32.2 
 
 
689 aa  95.1  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  27.46 
 
 
658 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  31.09 
 
 
670 aa  89.4  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  44.23 
 
 
729 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.26 
 
 
757 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  26.98 
 
 
615 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  30.85 
 
 
619 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  35.2 
 
 
616 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  30.92 
 
 
616 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  26.73 
 
 
571 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  31.63 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  26.27 
 
 
566 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  28.72 
 
 
688 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  26.27 
 
 
566 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  35.2 
 
 
618 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  34.4 
 
 
618 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  29.59 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  29.59 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  29.59 
 
 
346 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  25.23 
 
 
577 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  28.19 
 
 
655 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  28.19 
 
 
662 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  29.41 
 
 
688 aa  67  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  27.52 
 
 
350 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  25.47 
 
 
883 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  26.28 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  32.81 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  24.86 
 
 
471 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0260  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  24.84 
 
 
372 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  30.48 
 
 
349 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
266 aa  48.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  26.35 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  27.41 
 
 
359 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  26.54 
 
 
299 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  32.8 
 
 
331 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  29.63 
 
 
646 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  28.21 
 
 
885 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0325  cytochrome c family protein  26.8 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.278089  hitchhiker  0.0000311882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  28.91 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  26.05 
 
 
916 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  25.77 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  29.79 
 
 
329 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  29.05 
 
 
414 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  25.49 
 
 
359 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0862  hypothetical protein  27.47 
 
 
157 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  31.11 
 
 
623 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  33.04 
 
 
321 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0385  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  33.04 
 
 
321 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>