More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3910 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 376 aa  775    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  45.69 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  46.03 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  42.78 
 
 		 380 aa  326  5e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  44.88 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  42.08 
 
 		 379 aa  312  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  40.11 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  39.44 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  36.77 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  40.05 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  39.36 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  37.17 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  38.36 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  38.46 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  37.63 
 
 		 386 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  37.63 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  39.26 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  38.8 
 
 		 382 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  38.13 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  35.73 
 
 		 380 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  36.65 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  35.9 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  35.47 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  38.52 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  37.96 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  39.37 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.86 
 
 		 388 aa  236  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  38.89 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  36.53 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  35.53 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  35.36 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  36.2 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  37.11 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  35.01 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  34.12 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  35.32 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  31.52 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  32.63 
 
 		 381 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  32.81 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  33.6 
 
 		 385 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  34.56 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  32.11 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  34.12 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.64 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  34.15 
 
 		 878 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.08 
 
 		 879 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.71 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.2 
 
 		 414 aa  169  9e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  32.61 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  29.5 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  32.71 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.82 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.41 
 
 		 885 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.46 
 
 		 644 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  30 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.77 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  33.77 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  30.53 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  29.95 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.32 
 
 		 408 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  29.46 
 
 		 414 aa  156  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  30.99 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  31.4 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.11 
 
 		 408 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  30.83 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.61 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  29.46 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.61 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.57 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  30 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  31.09 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.17 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.26 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.83 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  30.16 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 572 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.86 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.79 
 
 		 413 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  29.77 
 
 		 405 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  29.77 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.27 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.27 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.42 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.94 
 
 		 896 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.46 
 
 		 449 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.89 
 
 		 415 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  29.9 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.4 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.46 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.17 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.08 
 
 		 880 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.5 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.61 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.02 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.41 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>