More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3852 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 320 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  47.66 
 
 		 312 aa  316  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  49.22 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  48.91 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  48.59 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  50.47 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 		 315 aa  298  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  48.88 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  48.56 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  48.28 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  48.24 
 
 		 315 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  48.24 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  45.79 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  47.66 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  44.86 
 
 		 317 aa  292  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  47.65 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  46.65 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  45.79 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  46.62 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  45.65 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  45.23 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  48.87 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  44.51 
 
 		 316 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  46.5 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  44.75 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 314 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  46.65 
 
 		 315 aa  281  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  44.1 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  44.1 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  44.1 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  45.05 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  46.93 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 312 aa  268  8.999999999999999e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.86 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 315 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  43.12 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  42.17 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  43.12 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 		 329 aa  258  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 307 aa  258  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  44.35 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  44.74 
 
 		 333 aa  255  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  43.64 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  44.73 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  40.67 
 
 		 317 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 302 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>