More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3851 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  100 
 
 
453 aa  931  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  49.67 
 
 
453 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  48.79 
 
 
452 aa  406  1e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  46.05 
 
 
452 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  46.78 
 
 
457 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  43.33 
 
 
452 aa  359  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  40.04 
 
 
455 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  42.07 
 
 
448 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  39.6 
 
 
449 aa  342  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  39.07 
 
 
448 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  41.59 
 
 
451 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  38.85 
 
 
448 aa  322  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  38.19 
 
 
446 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  42.22 
 
 
447 aa  316  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  40.62 
 
 
444 aa  313  4e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  38.53 
 
 
456 aa  312  8e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  34.63 
 
 
462 aa  310  3e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  39.78 
 
 
444 aa  305  9e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  39.11 
 
 
452 aa  305  1e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  39.51 
 
 
453 aa  304  2e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  36.59 
 
 
444 aa  303  4e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  36.51 
 
 
440 aa  302  7e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  39.47 
 
 
452 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  38.84 
 
 
444 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  38.34 
 
 
448 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  38.67 
 
 
444 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  38.22 
 
 
444 aa  299  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  38.44 
 
 
444 aa  298  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  38 
 
 
444 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  38 
 
 
444 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  38 
 
 
444 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  38 
 
 
444 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  38 
 
 
444 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  38 
 
 
444 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  36.53 
 
 
451 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.06 
 
 
449 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  36.42 
 
 
443 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  37.53 
 
 
451 aa  285  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  37.31 
 
 
451 aa  284  3e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  38.82 
 
 
451 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  36.38 
 
 
430 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  36.28 
 
 
443 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  37.64 
 
 
468 aa  275  1e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  36.7 
 
 
451 aa  274  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  36.22 
 
 
435 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  35.03 
 
 
446 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  35.86 
 
 
464 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  35.68 
 
 
445 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.7 
 
 
442 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  33.11 
 
 
442 aa  259  5e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.7 
 
 
449 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  33.86 
 
 
435 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  33.86 
 
 
435 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  37.17 
 
 
449 aa  253  4e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  34.89 
 
 
449 aa  253  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  37.47 
 
 
450 aa  245  1e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  33.9 
 
 
453 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.24 
 
 
429 aa  240  3e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  35.7 
 
 
447 aa  239  6e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  34.29 
 
 
452 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 
442 aa  236  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.53 
 
 
438 aa  234  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98868e-06 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  35.09 
 
 
442 aa  233  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.5 
 
 
424 aa  229  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  34.01 
 
 
436 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  34.22 
 
 
444 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  33.41 
 
 
440 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  32.75 
 
 
439 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  32.96 
 
 
431 aa  223  5e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  34.15 
 
 
431 aa  223  5e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.85655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.26 
 
 
448 aa  216  6e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  32.33 
 
 
432 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  32.05 
 
 
471 aa  213  5e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.59 
 
 
436 aa  213  5e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  31.2 
 
 
430 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  33.77 
 
 
432 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  34.93 
 
 
445 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.64 
 
 
445 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  28.67 
 
 
428 aa  208  2e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  35.31 
 
 
448 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.77 
 
 
438 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  33.26 
 
 
501 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.38 
 
 
444 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  30.87 
 
 
431 aa  198  1e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  38.05 
 
 
434 aa  197  2e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  34.52 
 
 
436 aa  197  5e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  1.805e-13 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  33.17 
 
 
434 aa  196  5e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  34.76 
 
 
436 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  1.36476e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  31.21 
 
 
429 aa  196  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  4.68931e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  28.74 
 
 
406 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  31.63 
 
 
427 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  34.05 
 
 
436 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  5.06957e-07 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  34.07 
 
 
455 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  31.61 
 
 
429 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  31.5 
 
 
438 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  31.61 
 
 
429 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  34.05 
 
 
436 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  31.25 
 
 
438 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  31.61 
 
 
429 aa  193  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  31.61 
 
 
429 aa  193  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>