More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3754 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  100 
 
 
170 aa  349  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  45.56 
 
 
186 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  49.41 
 
 
184 aa  158  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  46.99 
 
 
185 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  51.27 
 
 
173 aa  157  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  46.75 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  47.8 
 
 
171 aa  140  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  43.9 
 
 
190 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.21 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  41.4 
 
 
187 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  38.55 
 
 
198 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  41.61 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  40.33 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  41.21 
 
 
199 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  41.36 
 
 
209 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  39.26 
 
 
193 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  39.26 
 
 
192 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  40.61 
 
 
200 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  40.61 
 
 
200 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  42.51 
 
 
214 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  39.02 
 
 
198 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  41.5 
 
 
189 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  40.25 
 
 
220 aa  121  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  37.22 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  35.76 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  40.33 
 
 
225 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  41.21 
 
 
225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  42.57 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  39.76 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  42.17 
 
 
243 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  38.55 
 
 
243 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  41.82 
 
 
192 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  39.41 
 
 
183 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  37.82 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  38.92 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  38.61 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  39.31 
 
 
219 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  35.39 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  41.72 
 
 
191 aa  114  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  40.36 
 
 
190 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  34.83 
 
 
177 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  35.39 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  37.57 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  37.06 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  35.8 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  37.06 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  35.39 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  35 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  37.95 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.38 
 
 
215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  37.97 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.06 
 
 
221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  38.46 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  38.01 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  38.46 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.33 
 
 
240 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  41.84 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  36.87 
 
 
216 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  35.43 
 
 
174 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  39.74 
 
 
206 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  37.57 
 
 
221 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  40 
 
 
214 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  38.73 
 
 
216 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  34.78 
 
 
197 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  41.32 
 
 
222 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  40.23 
 
 
215 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  40.43 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  36.47 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  36.47 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  36.47 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  35.39 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  36.47 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  37.65 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  36.47 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  33.16 
 
 
248 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  33.16 
 
 
248 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  36.47 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  36.47 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35.83 
 
 
262 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  36.47 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  36.87 
 
 
220 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  41.5 
 
 
349 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  41.5 
 
 
349 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  33.15 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  31.55 
 
 
324 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  37.58 
 
 
177 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  36.97 
 
 
177 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.79 
 
 
270 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  34.83 
 
 
187 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  34.83 
 
 
187 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  34.83 
 
 
187 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  38.96 
 
 
184 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  39.18 
 
 
182 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  37.5 
 
 
182 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  35.06 
 
 
219 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  35.39 
 
 
187 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  34.83 
 
 
187 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  33.51 
 
 
257 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  36.02 
 
 
217 aa  104  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  33.01 
 
 
268 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>