More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3676 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 
890 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 
890 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  58.33 
 
 
898 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  59.83 
 
 
883 aa  722    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  57.68 
 
 
894 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 
979 aa  653    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  56.21 
 
 
896 aa  668    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  62.26 
 
 
720 aa  741    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  56.17 
 
 
985 aa  981    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  58.24 
 
 
964 aa  668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  65.41 
 
 
686 aa  766    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 
889 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 
971 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 
927 aa  659    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 
885 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  57.31 
 
 
948 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  65.24 
 
 
686 aa  764    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  65.58 
 
 
686 aa  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  65.58 
 
 
686 aa  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
975 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  66.96 
 
 
692 aa  770    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 
890 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 
880 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 
904 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  56.14 
 
 
992 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  57.93 
 
 
895 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  58.05 
 
 
966 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  56.05 
 
 
922 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  58.52 
 
 
943 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 
880 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
975 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  61.55 
 
 
705 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
975 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 
882 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.8 
 
 
947 aa  683    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  59.69 
 
 
972 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 
915 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  56.03 
 
 
956 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  59.45 
 
 
965 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 
729 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  58.19 
 
 
884 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 
984 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  65.24 
 
 
686 aa  764    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 
1128 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 
890 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  56.19 
 
 
876 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  64.62 
 
 
689 aa  759    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  62.03 
 
 
903 aa  815    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  59.69 
 
 
976 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
975 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 
880 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 
890 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  54.74 
 
 
894 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
975 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  57.07 
 
 
907 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  56.59 
 
 
968 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  59.45 
 
 
989 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  54.6 
 
 
884 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  64.44 
 
 
688 aa  756    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  56.43 
 
 
843 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  57.14 
 
 
943 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  58.39 
 
 
979 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  55.57 
 
 
880 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  51.06 
 
 
1131 aa  921    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  58.1 
 
 
898 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 
971 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  55 
 
 
885 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  58.84 
 
 
972 aa  668    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  56.53 
 
 
752 aa  670    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  46.77 
 
 
1008 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  64.48 
 
 
679 aa  755    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  64.48 
 
 
679 aa  755    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  57 
 
 
831 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  52.29 
 
 
1059 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 
885 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 
885 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 
969 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 
881 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  57.47 
 
 
882 aa  770    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  58.84 
 
 
971 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  57.76 
 
 
890 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 
738 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
975 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.44 
 
 
882 aa  664    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 
890 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  57.26 
 
 
943 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 
971 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  59 
 
 
962 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.38 
 
 
949 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 
889 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  57.51 
 
 
953 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 
975 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  58.84 
 
 
921 aa  728    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 
888 aa  781    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  61.55 
 
 
705 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  66.2 
 
 
1035 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 
882 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 
964 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  54.71 
 
 
896 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 
1079 aa  725    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>