75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3630 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  100 
 
 
166 aa  347  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.85954e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  36.11 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  36.75 
 
 
174 aa  83.2  1e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  33.57 
 
 
158 aa  82.4  3e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  35.34 
 
 
153 aa  80.1  1e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  32.41 
 
 
159 aa  79.7  2e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.61 
 
 
205 aa  79.3  2e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  32.61 
 
 
125 aa  77.4  8e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  32.58 
 
 
158 aa  76.6  1e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  32.17 
 
 
155 aa  77  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  33.8 
 
 
153 aa  73.2  1e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  33.11 
 
 
203 aa  72  3e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  33.56 
 
 
153 aa  70.1  1e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.97678e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  30.91 
 
 
171 aa  68.2  4e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  30.91 
 
 
171 aa  67  1e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  30.91 
 
 
171 aa  67  1e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  31.65 
 
 
154 aa  65.9  3e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  31.43 
 
 
159 aa  65.5  3e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  26.06 
 
 
164 aa  65.5  3e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  30.2 
 
 
152 aa  64.3  7e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  34.17 
 
 
134 aa  63.5  1e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  29.86 
 
 
161 aa  63.2  2e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  28.22 
 
 
166 aa  62.4  2e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.95 
 
 
158 aa  60.8  7e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  25.31 
 
 
177 aa  58.2  6e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  36.79 
 
 
154 aa  57.8  6e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  31.37 
 
 
185 aa  54.7  6e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  26.9 
 
 
177 aa  54.3  7e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  26.21 
 
 
151 aa  54.3  8e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0614  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  28.09 
 
 
190 aa  53.1  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  25.52 
 
 
151 aa  52.8  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  25.52 
 
 
151 aa  52.8  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.56 
 
 
180 aa  51.2  7e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  26.47 
 
 
200 aa  47.8  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  26.47 
 
 
200 aa  47.8  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  26.47 
 
 
200 aa  47.8  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  26.47 
 
 
200 aa  47.8  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  26.47 
 
 
200 aa  47.8  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  23.31 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  26.09 
 
 
200 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  27.61 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  26.09 
 
 
199 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  26.09 
 
 
199 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4075  NapC/NirT cytochrome c-like  23.6 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621031  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  25.99 
 
 
234 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  21.58 
 
 
390 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  21.58 
 
 
390 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  26.71 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  20.86 
 
 
390 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4005  NapC/NirT cytochrome c domain protein  23.12 
 
 
206 aa  43.9  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  20.86 
 
 
390 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  20.86 
 
 
390 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  20.86 
 
 
390 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  26.71 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  20.86 
 
 
390 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.19 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  6.71983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  20.86 
 
 
390 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  23.81 
 
 
386 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  4.48194e-07 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  26.88 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4076  NapC/NirT cytochrome c-like  23.27 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0547067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  27.33 
 
 
368 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3484  cytochrome c-type protein NapC  26.49 
 
 
205 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382018  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  28.57 
 
 
507 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.62424e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  27.73 
 
 
507 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  26.04 
 
 
364 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1339  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.09 
 
 
233 aa  40.8  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  20.22 
 
 
394 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  20.22 
 
 
394 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>