289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3621 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 
93 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  43.68 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1693  protein translocase subunit yajC  51.85 
 
 
89 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155414  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  39.25 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  38.05 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  41.57 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  45.78 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  45.78 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1121  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00511918  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  43.42 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  44.58 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  41.41 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  41.41 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  43.9 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  39.76 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  34.41 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.02 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  34.58 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  37.35 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
117 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  45.68 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  36.78 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  40.96 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  39.39 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  42.67 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  34.62 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  44.93 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.35 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  37.14 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  37.04 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  33.73 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  36.05 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>