More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3609 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.05 
 
 
813 aa  749    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2572  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.61 
 
 
748 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.43 
 
 
804 aa  709    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  49.1 
 
 
729 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  45.16 
 
 
728 aa  670    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  47.44 
 
 
716 aa  708    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.25 
 
 
766 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.76 
 
 
728 aa  659    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1196  GTP pyrophosphokinase  48.96 
 
 
729 aa  704    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0487271  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0910  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.61 
 
 
726 aa  661    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.746196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4122  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.51 
 
 
774 aa  677    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  833    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1940  GTP pyrophosphokinase family protein  46.11 
 
 
738 aa  644    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.891198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.92 
 
 
745 aa  692    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000459955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.52 
 
 
716 aa  723    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.46 
 
 
716 aa  788    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000855141  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.85 
 
 
721 aa  667    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  55.8 
 
 
727 aa  832    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4140  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  55.94 
 
 
727 aa  833    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4151  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  55.94 
 
 
727 aa  836    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  834    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.34 
 
 
790 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1433  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.44 
 
 
743 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  45.77 
 
 
790 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000342988  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1311  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.99 
 
 
738 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  54.95 
 
 
726 aa  834    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000567155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  48.63 
 
 
814 aa  701    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  58.59 
 
 
725 aa  889    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.22 
 
 
729 aa  777    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  100 
 
 
726 aa  1495    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4989  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  49.02 
 
 
751 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  833    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1999  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.1 
 
 
790 aa  692    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.46 
 
 
732 aa  855    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3042  (p)ppGpp synthetase I  48.19 
 
 
758 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  46.21 
 
 
789 aa  664    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1459  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.44 
 
 
743 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  47.03 
 
 
716 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000013827  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1569  metal dependent phosphohydrolase  48.22 
 
 
715 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3048  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.11 
 
 
815 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  55.8 
 
 
727 aa  832    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0193  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  45.39 
 
 
769 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1377  metal dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 
779 aa  697    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.790837  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0787  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.18 
 
 
722 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.239727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  58.9 
 
 
721 aa  895    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000178164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  61.93 
 
 
717 aa  933    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.08 
 
 
724 aa  840    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000566061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  45.42 
 
 
746 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1376  (p)ppGpp synthetase I  45.89 
 
 
862 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  0.0959859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  45.17 
 
 
809 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.698973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  56.14 
 
 
726 aa  837    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  49.1 
 
 
729 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2720  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.54 
 
 
802 aa  659    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865135  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.52 
 
 
727 aa  832    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  833    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000280159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.86 
 
 
771 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 
806 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.14 
 
 
746 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0175  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  45.57 
 
 
740 aa  651    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.56 
 
 
716 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 
801 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.83 
 
 
742 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.5 
 
 
727 aa  716    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  47.81 
 
 
812 aa  690    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  54.94 
 
 
726 aa  820    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  54.52 
 
 
726 aa  815    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.17 
 
 
716 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2653  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.84 
 
 
750 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5139  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.71 
 
 
879 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2027  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.15 
 
 
763 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.27 
 
 
716 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000534468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.03 
 
 
827 aa  685    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  0.00000728185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1536  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.48 
 
 
719 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2057  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.9 
 
 
716 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250061  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02201  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  45.24 
 
 
769 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02111  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  45.33 
 
 
769 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  57.3 
 
 
734 aa  851    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02091  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  44.78 
 
 
769 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.58 
 
 
793 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.14 
 
 
746 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0092  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  47.69 
 
 
740 aa  682    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  46.63 
 
 
748 aa  672    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  49.27 
 
 
750 aa  725    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1367  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  45.24 
 
 
731 aa  650    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.709372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0200  (p)ppGpp synthetase  47.22 
 
 
739 aa  662    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.546884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.12 
 
 
797 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0431  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.38 
 
 
715 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  47.02 
 
 
856 aa  672    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  834    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.55 
 
 
820 aa  715    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.28 
 
 
717 aa  714    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  45.87 
 
 
743 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  45.89 
 
 
815 aa  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  45.25 
 
 
774 aa  648    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 
801 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4829  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.93 
 
 
749 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.34 
 
 
788 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  43.75 
 
 
759 aa  636    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.37 
 
 
717 aa  653    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.66 
 
 
727 aa  830    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>