More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3609 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  47.02 
 
 
856 aa  672  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.34 
 
 
788 aa  682  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.37 
 
 
717 aa  653  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  43.75 
 
 
759 aa  636  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02091  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  44.78 
 
 
769 aa  639  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02201  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  45.24 
 
 
769 aa  641  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.08 
 
 
724 aa  840  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.66061e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.46 
 
 
732 aa  855  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 
806 aa  678  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02111  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  45.33 
 
 
769 aa  643  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1999  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.1 
 
 
790 aa  692  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  58.9 
 
 
721 aa  895  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78164e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.34 
 
 
790 aa  680  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  54.95 
 
 
726 aa  834  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.67155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  45.89 
 
 
815 aa  684  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.46 
 
 
716 aa  788  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.55141e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.41 
 
 
801 aa  679  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.52 
 
 
716 aa  723  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06243e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  45.87 
 
 
743 aa  669  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  46.21 
 
 
789 aa  664  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1459  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.44 
 
 
743 aa  690  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  57.3 
 
 
734 aa  851  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  47.81 
 
 
812 aa  690  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.58 
 
 
793 aa  692  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0092  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  47.69 
 
 
740 aa  682  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  46.63 
 
 
748 aa  672  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  49.27 
 
 
750 aa  725  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1367  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  45.24 
 
 
731 aa  650  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.709372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0200  (p)ppGpp synthetase  47.22 
 
 
739 aa  662  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.546884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.12 
 
 
797 aa  690  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.85 
 
 
721 aa  667  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.25 
 
 
766 aa  687  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.55 
 
 
820 aa  715  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.28 
 
 
717 aa  714  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  56.14 
 
 
726 aa  837  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.14 
 
 
746 aa  652  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.86 
 
 
771 aa  679  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1433  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.44 
 
 
743 aa  690  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  834  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.5 
 
 
727 aa  716  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  833  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5139  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.71 
 
 
879 aa  672  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2057  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.9 
 
 
716 aa  645  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.50061e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.03 
 
 
827 aa  685  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  7.28185e-06 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.05 
 
 
813 aa  749  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.17 
 
 
716 aa  719  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.14 
 
 
746 aa  652  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.52 
 
 
727 aa  832  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0901  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.6 
 
 
712 aa  820  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0988529  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  45.25 
 
 
774 aa  648  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.56 
 
 
716 aa  709  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4829  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.93 
 
 
749 aa  687  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1311  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.99 
 
 
738 aa  653  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.66 
 
 
727 aa  830  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.76 
 
 
728 aa  659  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2027  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.15 
 
 
763 aa  667  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74552e-09 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2572  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.61 
 
 
748 aa  657  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.27 
 
 
716 aa  710  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.34468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1536  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.48 
 
 
719 aa  644  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  49.1 
 
 
729 aa  729  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.92 
 
 
745 aa  692  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.59955e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4122  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.51 
 
 
774 aa  677  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  45.77 
 
 
790 aa  676  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.42988e-06  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  100 
 
 
726 aa  1495  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  49.1 
 
 
729 aa  729  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  833  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.80159e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  834  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3048  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.11 
 
 
815 aa  674  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0787  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.18 
 
 
722 aa  649  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.239727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.22 
 
 
729 aa  777  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0910  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.61 
 
 
726 aa  661  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.746196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  47.03 
 
 
716 aa  697  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.3827e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6106  GTP diphosphokinase  47.35 
 
 
785 aa  698  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364718  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  45.16 
 
 
728 aa  666  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  48.63 
 
 
814 aa  701  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  55.8 
 
 
727 aa  832  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.01 
 
 
781 aa  700  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.84 
 
 
721 aa  659  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4989  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  49.02 
 
 
751 aa  691  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1213  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.38 
 
 
756 aa  647  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.167676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.43 
 
 
804 aa  709  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1569  metal dependent phosphohydrolase  48.22 
 
 
715 aa  664  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  47.73 
 
 
775 aa  692  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.091974 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  55.8 
 
 
727 aa  832  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0193  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  45.39 
 
 
769 aa  643  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1377  metal dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 
779 aa  697  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.790837  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0704  GTP diphosphokinase  45.32 
 
 
783 aa  655  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.67 
 
 
714 aa  684  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3042  (p)ppGpp synthetase I  48.19 
 
 
758 aa  679  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0842  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.09 
 
 
817 aa  689  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461248  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  45.16 
 
 
728 aa  670  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  48.13 
 
 
786 aa  717  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1196  GTP pyrophosphokinase  48.96 
 
 
729 aa  704  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0487271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1945  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.13 
 
 
779 aa  678  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.712963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1801  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.42 
 
 
795 aa  674  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.0273265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  47.44 
 
 
716 aa  708  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  55.94 
 
 
727 aa  833  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1940  GTP pyrophosphokinase family protein  46.11 
 
 
738 aa  644  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.891198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3821  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.81 
 
 
787 aa  667  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.438652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3171  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.88 
 
 
861 aa  688  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>