More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3583 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  100 
 
 
437 aa  901    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  63.02 
 
 
450 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  60 
 
 
438 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  58.69 
 
 
435 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  54.67 
 
 
447 aa  501  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  58.22 
 
 
441 aa  494  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  59.71 
 
 
458 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  57.94 
 
 
739 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  55.74 
 
 
444 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  57.35 
 
 
731 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  54.11 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  56.43 
 
 
422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  55.39 
 
 
432 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.44 
 
 
726 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.04 
 
 
721 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  50.59 
 
 
432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.1 
 
 
733 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  51.13 
 
 
440 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.7 
 
 
735 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  53.99 
 
 
459 aa  441  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  51.09 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.93 
 
 
734 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  52.01 
 
 
434 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  51.34 
 
 
455 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.46 
 
 
734 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  51.77 
 
 
434 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 
435 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 
440 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 
441 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
435 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  55.99 
 
 
436 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  54.13 
 
 
463 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  50.71 
 
 
447 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  48.42 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.89 
 
 
457 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 
457 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  47.41 
 
 
457 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  51.91 
 
 
446 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  50.23 
 
 
494 aa  408  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  54.74 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  49.51 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  54.52 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  49.28 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  46.19 
 
 
463 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 
519 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  50.49 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  48.66 
 
 
446 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  47.68 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  47.68 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 
428 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 
428 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  51.22 
 
 
435 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  47.43 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  49.01 
 
 
423 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  47.68 
 
 
434 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  53.16 
 
 
456 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  49.52 
 
 
446 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 
443 aa  393  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  47.68 
 
 
428 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  47.68 
 
 
428 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  44.91 
 
 
428 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  45.28 
 
 
429 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  48.21 
 
 
456 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 
456 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 
477 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  47.99 
 
 
461 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  45.9 
 
 
428 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  49.03 
 
 
448 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 
505 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 
456 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  47.82 
 
 
429 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  43.16 
 
 
429 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.52 
 
 
453 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  48.53 
 
 
465 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 
429 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  48.45 
 
 
500 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  50.37 
 
 
448 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 
445 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  50 
 
 
502 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 
459 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 
445 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 
451 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 
445 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 
429 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
444 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.59 
 
 
435 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 
437 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  47.28 
 
 
447 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.47 
 
 
437 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 
437 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  46.03 
 
 
446 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 
447 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>