More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3542 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
157 aa  319  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  56.13 
 
 
160 aa  190  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
155 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
155 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.79 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
154 aa  130  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
154 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  39.47 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  39.47 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.01 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  40.13 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  40.13 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  40.13 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
157 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
159 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
154 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
156 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 
156 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
154 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
158 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
167 aa  121  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
155 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  39.33 
 
 
164 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  39.33 
 
 
164 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
164 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  39.33 
 
 
155 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
155 aa  120  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
157 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  37.34 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.06 
 
 
155 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 
154 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 
171 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
169 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  35.06 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
156 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
156 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
200 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
161 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
200 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
161 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.09 
 
 
153 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  39.44 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
161 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  36.99 
 
 
164 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
167 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
153 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
155 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
158 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
165 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
157 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>