More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3520 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
145 aa  303  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 
147 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 
147 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.57 
 
 
145 aa  156  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 
145 aa  155  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
145 aa  155  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.71 
 
 
142 aa  155  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.01 
 
 
148 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 
157 aa  154  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.06 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
145 aa  150  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 
144 aa  150  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 
145 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
151 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
150 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
142 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  56.15 
 
 
144 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
150 aa  148  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 
159 aa  148  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 
156 aa  147  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
153 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
153 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
172 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.05 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  52.9 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.1 
 
 
150 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 
150 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
141 aa  144  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
144 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
149 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
147 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 
184 aa  143  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
161 aa  144  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
147 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
145 aa  143  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 
151 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 
149 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
146 aa  142  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 
152 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 
151 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
145 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.97 
 
 
147 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
150 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.15 
 
 
152 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 
160 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
148 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
150 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
150 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 
165 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
144 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
149 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
144 aa  141  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
148 aa  140  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 
146 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 
146 aa  140  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 
146 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
146 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
148 aa  140  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
162 aa  140  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.75 
 
 
150 aa  140  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
147 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
150 aa  139  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
144 aa  139  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 
146 aa  139  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  55.04 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.06 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
207 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  50 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
207 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
148 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 
151 aa  137  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>