More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3501 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  100 
 
 
463 aa  935    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  69.55 
 
 
463 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  67.84 
 
 
466 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  68.28 
 
 
469 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  64.92 
 
 
464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  66.81 
 
 
468 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  64.49 
 
 
469 aa  588  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  63.46 
 
 
469 aa  588  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  62.04 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  62.33 
 
 
466 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  60.26 
 
 
476 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  60.22 
 
 
477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  60.52 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  60.78 
 
 
480 aa  558  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  60.56 
 
 
482 aa  559  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.74 
 
 
761 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.69 
 
 
479 aa  557  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  62.03 
 
 
455 aa  555  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.39 
 
 
457 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  60 
 
 
468 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  59.78 
 
 
468 aa  551  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  59.65 
 
 
480 aa  550  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.95 
 
 
480 aa  548  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  59.09 
 
 
483 aa  544  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.08 
 
 
465 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  58.52 
 
 
465 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  57.86 
 
 
465 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  59.35 
 
 
503 aa  538  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.7 
 
 
463 aa  535  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.23 
 
 
497 aa  532  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  59.52 
 
 
468 aa  529  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  59.4 
 
 
476 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  59.31 
 
 
468 aa  531  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  58.01 
 
 
469 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.04 
 
 
461 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  58.62 
 
 
476 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.57 
 
 
474 aa  525  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  58.39 
 
 
471 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  59.27 
 
 
476 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  59.78 
 
 
481 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.45 
 
 
476 aa  521  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  59.74 
 
 
470 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  55.19 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  61.35 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.57 
 
 
469 aa  512  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  57.33 
 
 
1005 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.77 
 
 
464 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  60.4 
 
 
473 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.95 
 
 
466 aa  511  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  57.61 
 
 
469 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  57.39 
 
 
469 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  56.62 
 
 
462 aa  505  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.75 
 
 
467 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  57.05 
 
 
1011 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  57.05 
 
 
1011 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  56.99 
 
 
1008 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  58.57 
 
 
446 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.75 
 
 
458 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  55.38 
 
 
994 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  56.77 
 
 
473 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.02 
 
 
467 aa  488  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.73 
 
 
465 aa  487  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  56.06 
 
 
994 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  56.53 
 
 
747 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.2 
 
 
447 aa  477  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.14 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.26 
 
 
447 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  50.87 
 
 
477 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  46.72 
 
 
465 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.13 
 
 
483 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.59 
 
 
438 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  45.15 
 
 
465 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.08 
 
 
699 aa  351  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  43.37 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  42.8 
 
 
947 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.09 
 
 
658 aa  326  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  43.65 
 
 
1150 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  39.13 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.56 
 
 
659 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  39.13 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.33 
 
 
659 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.02 
 
 
555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  39.33 
 
 
659 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  39.33 
 
 
659 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.33 
 
 
659 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  39.91 
 
 
483 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  39.33 
 
 
659 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.33 
 
 
659 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  41.47 
 
 
942 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.72 
 
 
996 aa  319  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  39.35 
 
 
485 aa  319  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  42 
 
 
411 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  41.47 
 
 
944 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  39.43 
 
 
469 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 
440 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  38.28 
 
 
472 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.11 
 
 
659 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  39.14 
 
 
472 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  46.22 
 
 
707 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  41.03 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>