52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3466 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
121 aa  243  5e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 
137 aa  70.1  1e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 
142 aa  63.9  6e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  47.06 
 
 
74 aa  63.9  7e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 
231 aa  63.2  1e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
70 aa  57  8e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
139 aa  54.7  4e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
73 aa  53.9  6e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 
301 aa  53.9  8e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 
115 aa  53.9  8e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 
115 aa  53.9  8e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 
158 aa  53.5  1e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
104 aa  48.9  3e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  32.35 
 
 
114 aa  47.8  5e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
75 aa  47.4  6e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
75 aa  47.4  6e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
75 aa  47.4  6e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 
152 aa  47.8  6e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  31.82 
 
 
99 aa  47.4  7e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
124 aa  47  9e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  34.67 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 
262 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 
262 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
321 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.57 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  39.62 
 
 
262 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  35.71 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  35.85 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
327 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
127 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
78 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0858  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 
243 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.949499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.73 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.33 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  40.68 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  32.31 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
210 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  9.33135e-05 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.71 
 
 
149 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  2.09993e-08 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  30.86 
 
 
484 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>