More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3455 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 583 aa  1204    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 		 561 aa  495  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.03 
 
 		 561 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  45.67 
 
 		 566 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.68 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.56 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.68 
 
 		 582 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.75 
 
 		 563 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.92 
 
 		 563 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  44.62 
 
 		 561 aa  485  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.75 
 
 		 582 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.75 
 
 		 563 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.75 
 
 		 563 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 		 539 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  45.39 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.19 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  44.66 
 
 		 569 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  44.76 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  46.94 
 
 		 549 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 		 559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  42.81 
 
 		 583 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 584 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 		 573 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.26 
 
 		 585 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  44.04 
 
 		 564 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 		 585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  43.55 
 
 		 565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 584 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 		 543 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  40.58 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 		 590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.29 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.06 
 
 		 514 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 567 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.55 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.73 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.29 
 
 		 510 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 		 564 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 544 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.29 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 560 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.62 
 
 		 512 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.31 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.66 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.39 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  38.86 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.58 
 
 		 560 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.52 
 
 		 557 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 512 aa  363  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  38.34 
 
 		 569 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 		 552 aa  360  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 564 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 548 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 		 561 aa  356  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 562 aa  355  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 559 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 553 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  38.93 
 
 		 514 aa  353  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 520 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 		 567 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 552 aa  349  8e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 		 561 aa  349  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 583 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.07 
 
 		 583 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  38.07 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.07 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 577 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.07 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.47 
 
 		 567 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  38.07 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.07 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.07 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.25 
 
 		 560 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 		 490 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.77 
 
 		 561 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>