More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3357 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  47.67 
 
 		 276 aa  251  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  46.67 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  46.24 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.13 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  46.15 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.65 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.47 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.47 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.88 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  44.8 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.24 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  46.24 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  44.8 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  45 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  43.32 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  42.46 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.48 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.21 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.86 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  42.14 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  46.89 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  39.71 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  42.25 
 
 		 329 aa  198  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  41.88 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.93 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.54 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  43.88 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.28 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  40.8 
 
 		 378 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.98 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  34.34 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.38 
 
 		 395 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.51 
 
 		 396 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  35.51 
 
 		 396 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.02 
 
 		 454 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  38.82 
 
 		 396 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.08 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.33 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  35.51 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.2 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.38 
 
 		 395 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.14 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.51 
 
 		 396 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  35.14 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  35.14 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  35.87 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.87 
 
 		 401 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  35.87 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  35.87 
 
 		 408 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  35.87 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.48 
 
 		 390 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  35.87 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  41.35 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  35.87 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  35.87 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.17 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  35.87 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.98 
 
 		 394 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  35.87 
 
 		 403 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.44 
 
 		 361 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.78 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.7 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.7 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  37.64 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.94 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.78 
 
 		 405 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.43 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  34.18 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  36.43 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  35.32 
 
 		 407 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  35.43 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.02 
 
 		 309 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.47 
 
 		 340 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  41.47 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  36.86 
 
 		 397 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  38.96 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  36.53 
 
 		 379 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.01 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.17 
 
 		 444 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  33.13 
 
 		 465 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  33.96 
 
 		 444 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  33.02 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  35.77 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.47 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  31.36 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  34.18 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 391 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  35.57 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.75 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  33.11 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  37.22 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  35.18 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  34.35 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  34.23 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  33.65 
 
 		 442 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  33.11 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  35.02 
 
 		 326 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  35.02 
 
 		 326 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>