More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3226 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 392 aa  766    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  39.56 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 424 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 398 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  34.1 
 
 		 424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  34.16 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 396 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  34.08 
 
 		 408 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  31.65 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 390 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.16 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  34.16 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  32.04 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  27.37 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  29.37 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 419 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  30.83 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  29.63 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.43 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.43 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  30.29 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 414 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  30.53 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  33.05 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 421 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 442 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  32.35 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  29.29 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  29.77 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  29.37 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  31.96 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.29 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  29.1 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  28.84 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  28.84 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  29.1 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  33.43 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  29.1 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  31.66 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.24 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  30.51 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  30.51 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  30.51 
 
 		 399 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 398 aa  137  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  29.82 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  29.17 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>