101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3222 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
747 aa  1527  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  66.55 
 
 
322 aa  341  3e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53302e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  30.53 
 
 
462 aa  217  6e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  39.66 
 
 
346 aa  166  1e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  38.14 
 
 
350 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.43065e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  151  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  32.98 
 
 
336 aa  149  2e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  33.72 
 
 
338 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  35.96 
 
 
296 aa  142  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 
352 aa  141  5e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  30.75 
 
 
719 aa  134  7e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  30.35 
 
 
728 aa  132  2e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  35.42 
 
 
365 aa  130  1e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  27.67 
 
 
750 aa  121  4e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25.63 
 
 
617 aa  121  4e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  24.44 
 
 
640 aa  119  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  22.52 
 
 
632 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  28.43 
 
 
614 aa  118  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  22.91 
 
 
629 aa  116  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  22.91 
 
 
629 aa  116  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  26.98 
 
 
322 aa  114  1e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.04 
 
 
619 aa  113  1e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  24.93 
 
 
562 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  30.57 
 
 
442 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  23.09 
 
 
647 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  25.83 
 
 
302 aa  97.4  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.7 
 
 
858 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  30.68 
 
 
345 aa  97.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  23.86 
 
 
632 aa  95.5  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.97 
 
 
589 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  27.87 
 
 
754 aa  85.5  4e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.9 
 
 
465 aa  83.2  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  22.57 
 
 
596 aa  82.8  2e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  28.05 
 
 
397 aa  80.5  1e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.42 
 
 
405 aa  80.5  1e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  27.85 
 
 
403 aa  75.1  4e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  28.57 
 
 
833 aa  73.9  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.90469e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  22.44 
 
 
519 aa  73.6  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  19.31 
 
 
585 aa  73.2  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  19.31 
 
 
585 aa  73.2  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  19.31 
 
 
585 aa  73.2  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  32.7 
 
 
404 aa  73.2  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  24.71 
 
 
598 aa  72  3e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  24.1 
 
 
557 aa  69.3  3e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  34.72 
 
 
417 aa  68.9  3e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  24.41 
 
 
210 aa  67.4  1e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.97 
 
 
383 aa  67  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.62756e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  25.57 
 
 
480 aa  64.3  8e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.80148e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  35.34 
 
 
581 aa  63.9  9e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  27.71 
 
 
649 aa  63.2  2e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  30.65 
 
 
718 aa  62  4e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  33.82 
 
 
559 aa  60.5  1e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  33.82 
 
 
563 aa  60.1  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  33.05 
 
 
596 aa  60.5  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  33.82 
 
 
559 aa  60.5  1e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  33.82 
 
 
563 aa  60.1  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  33.82 
 
 
540 aa  60.1  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  33.82 
 
 
563 aa  60.1  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  33.82 
 
 
563 aa  60.1  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  26.26 
 
 
477 aa  59.7  2e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  24.58 
 
 
660 aa  58.2  6e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  44.05 
 
 
486 aa  56.6  2e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  36.26 
 
 
652 aa  55.5  4e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  28.82 
 
 
413 aa  55.5  4e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 
382 aa  55.5  4e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  25.72 
 
 
590 aa  54.7  6e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  34.52 
 
 
487 aa  54.3  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0433  hypothetical protein  26.01 
 
 
313 aa  53.9  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  24.62 
 
 
651 aa  53.5  1e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  29.03 
 
 
299 aa  53.9  1e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  30.36 
 
 
467 aa  53.1  2e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
331 aa  52.4  3e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  21.93 
 
 
671 aa  52.8  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1843  hypothetical protein  25.17 
 
 
319 aa  52.4  3e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.17396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  24.49 
 
 
631 aa  51.6  5e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  26.97 
 
 
203 aa  51.6  5e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  30.23 
 
 
215 aa  51.6  5e-05  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2059  hypothetical protein  24.84 
 
 
203 aa  51.2  6e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0850085  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  36.45 
 
 
361 aa  51.6  6e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  30.94 
 
 
647 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.33 
 
 
420 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0832  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  42.22 
 
 
61 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  23 
 
 
541 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.57 
 
 
646 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  22 
 
 
379 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 
750 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
1118 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  32.29 
 
 
430 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  41.94 
 
 
402 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  24.62 
 
 
700 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  17.77 
 
 
585 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  36.71 
 
 
686 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  24.24 
 
 
423 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  35.96 
 
 
1138 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  34.85 
 
 
249 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  29.84 
 
 
556 aa  45.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  25.78 
 
 
529 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  30.7 
 
 
179 aa  44.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.56 
 
 
447 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  27.73 
 
 
304 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>