More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3051 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  100 
 
 
286 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  39.86 
 
 
274 aa  208  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.64 
 
 
276 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  37.5 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  40.22 
 
 
280 aa  198  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  39.36 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  39.64 
 
 
277 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  39.64 
 
 
277 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  40 
 
 
277 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  39.65 
 
 
279 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.21 
 
 
272 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  42.09 
 
 
386 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  38.16 
 
 
311 aa  185  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.19 
 
 
283 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  38.11 
 
 
282 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  37.99 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.37 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  38.35 
 
 
315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.37 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  38.25 
 
 
295 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  37.28 
 
 
279 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  36.81 
 
 
303 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  35.84 
 
 
371 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.99 
 
 
355 aa  168  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.65 
 
 
359 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  37.59 
 
 
280 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  40 
 
 
293 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.08 
 
 
368 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  37.76 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  39.93 
 
 
291 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  39.51 
 
 
282 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.92 
 
 
356 aa  166  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.03 
 
 
413 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.4 
 
 
355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.72 
 
 
358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  35.46 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  37.85 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  35.84 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  33.92 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  38.77 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  38.77 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  37.32 
 
 
306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  36.3 
 
 
296 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  37.06 
 
 
314 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  36.07 
 
 
326 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  35.51 
 
 
278 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  36.92 
 
 
274 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  34.31 
 
 
359 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  35.94 
 
 
361 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  35.27 
 
 
359 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  36.75 
 
 
360 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  37.05 
 
 
318 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.93 
 
 
382 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  37.55 
 
 
277 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.01 
 
 
371 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.93 
 
 
373 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.07 
 
 
358 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.93 
 
 
365 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.57 
 
 
387 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  35.94 
 
 
402 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  39.64 
 
 
275 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  34.75 
 
 
349 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.23 
 
 
358 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  36.21 
 
 
311 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  36.79 
 
 
360 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  35.34 
 
 
363 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  36.4 
 
 
280 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  37.14 
 
 
300 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  33.69 
 
 
371 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  33.69 
 
 
371 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  36.69 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  35.46 
 
 
293 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  36.52 
 
 
305 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.1 
 
 
365 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  36.3 
 
 
274 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.37 
 
 
359 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  32.28 
 
 
706 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  33.69 
 
 
365 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.48 
 
 
358 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 
371 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  32.38 
 
 
364 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  33.69 
 
 
356 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.48 
 
 
358 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  30.96 
 
 
355 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.86 
 
 
359 aa  151  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  33.1 
 
 
365 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  35.59 
 
 
278 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  34.75 
 
 
362 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.1 
 
 
364 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  33.57 
 
 
327 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  33.1 
 
 
364 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.1 
 
 
367 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.13 
 
 
358 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  34.52 
 
 
286 aa  148  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.62 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  32.62 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  32.74 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  34.04 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  32.74 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>